Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KLHDC4Q8TBB5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KLHDC4Q8TBB5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
KLHDC4Q8TBB5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KLHDC4Q8TBB5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KLHDC4Q8TBB5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KLHDC4Q8TBB5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KLHDC4Q8TBB5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KLHDC4Q8TBB5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KLHDC4Q8TBB5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
KLHDC4Q8TBB5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KLHDC4Q8TBB5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KLHDC4Q8TBB5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KLHDC4Q8TBB5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KLHDC4Q8TBB5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KLHDC4Q8TBB5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KLHDC4Q8TBB5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KLHDC4Q8TBB5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
KLHDC4Q8TBB5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
KLHDC4Q8TBB5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
KLHDC4Q8TBB5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
KLHDC4Q8TBB5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KLHDC4Q8TBB5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
KLHDC4Q8TBB5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
KLHDC4Q8TBB5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KLHDC4Q8TBB5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
KLHDC4Q8TBB5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
KLHDC4Q8TBB5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KLHDC4Q8TBB5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KLHDC4Q8TBB5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KLHDC4Q8TBB5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KLHDC4Q8TBB5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
KLHDC4Q8TBB5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KLHDC4Q8TBB5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KLHDC4Q8TBB5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KLHDC4Q8TBB5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KLHDC4Q8TBB5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KLHDC4Q8TBB5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
KLHDC4Q8TBB5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KLHDC4Q8TBB5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
KLHDC4Q8TBB5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KLHDC4Q8TBB5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KLHDC4Q8TBB5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KLHDC4Q8TBB5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KLHDC4Q8TBB5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KLHDC4Q8TBB5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KLHDC4Q8TBB5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KLHDC4Q8TBB5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KLHDC4Q8TBB5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
KLHDC4Q8TBB5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KLHDC4Q8TBB5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KLHDC4Q8TBB5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KLHDC4Q8TBB5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
KLHDC4Q8TBB5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KLHDC4Q8TBB5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KLHDC4Q8TBB5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KLHDC4Q8TBB5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KLHDC4Q8TBB5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KLHDC4Q8TBB5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KLHDC4Q8TBB5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KLHDC4Q8TBB5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KLHDC4Q8TBB5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KLHDC4Q8TBB5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KLHDC4Q8TBB5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KLHDC4Q8TBB5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
KLHDC4Q8TBB5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KLHDC4Q8TBB5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KLHDC4Q8TBB5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KLHDC4Q8TBB5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KLHDC4Q8TBB5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KLHDC4Q8TBB5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KLHDC4Q8TBB5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KLHDC4Q8TBB5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KLHDC4Q8TBB5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KLHDC4Q8TBB5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KLHDC4Q8TBB5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KLHDC4Q8TBB5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KLHDC4Q8TBB5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KLHDC4Q8TBB5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
KLHDC4Q8TBB5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KLHDC4Q8TBB5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KLHDC4Q8TBB5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KLHDC4Q8TBB5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KLHDC4Q8TBB5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KLHDC4Q8TBB5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KLHDC4Q8TBB5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KLHDC4Q8TBB5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KLHDC4Q8TBB5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KLHDC4Q8TBB5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KLHDC4Q8TBB5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KLHDC4Q8TBB5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
KLHDC4Q8TBB5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KLHDC4Q8TBB5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KLHDC4Q8TBB5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KLHDC4Q8TBB5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KLHDC4Q8TBB5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KLHDC4Q8TBB5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KLHDC4Q8TBB5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KLHDC4Q8TBB5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KLHDC4Q8TBB5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms