Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB24

RIN3, Ras and Rab interactor 3, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIN3Q8TB24 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIN3Q8TB24 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIN3Q8TB24 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIN3Q8TB24 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIN3Q8TB24 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIN3Q8TB24 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIN3Q8TB24 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIN3Q8TB24 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIN3Q8TB24 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIN3Q8TB24 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIN3Q8TB24 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIN3Q8TB24 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIN3Q8TB24 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIN3Q8TB24 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIN3Q8TB24 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIN3Q8TB24 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIN3Q8TB24 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIN3Q8TB24 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIN3Q8TB24 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIN3Q8TB24 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIN3Q8TB24 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIN3Q8TB24 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIN3Q8TB24 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIN3Q8TB24 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIN3Q8TB24 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIN3Q8TB24 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RIN3Q8TB24 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RIN3Q8TB24 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RIN3Q8TB24 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RIN3Q8TB24 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIN3Q8TB24 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIN3Q8TB24 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RIN3Q8TB24 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIN3Q8TB24 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIN3Q8TB24 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIN3Q8TB24 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIN3Q8TB24 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIN3Q8TB24 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIN3Q8TB24 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIN3Q8TB24 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIN3Q8TB24 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RIN3Q8TB24 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIN3Q8TB24 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIN3Q8TB24 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIN3Q8TB24 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RIN3Q8TB24 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIN3Q8TB24 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIN3Q8TB24 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIN3Q8TB24 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIN3Q8TB24 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIN3Q8TB24 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIN3Q8TB24 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIN3Q8TB24 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIN3Q8TB24 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIN3Q8TB24 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIN3Q8TB24 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIN3Q8TB24 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIN3Q8TB24 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIN3Q8TB24 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIN3Q8TB24 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIN3Q8TB24 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIN3Q8TB24 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIN3Q8TB24 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIN3Q8TB24 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIN3Q8TB24 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIN3Q8TB24 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIN3Q8TB24 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIN3Q8TB24 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIN3Q8TB24 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIN3Q8TB24 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RIN3Q8TB24 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIN3Q8TB24 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RIN3Q8TB24 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIN3Q8TB24 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIN3Q8TB24 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms