Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI22

MCFD2, Multiple coagulation factor deficiency protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCFD2Q8NI22 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCFD2Q8NI22 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCFD2Q8NI22 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCFD2Q8NI22 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCFD2Q8NI22 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCFD2Q8NI22 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCFD2Q8NI22 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCFD2Q8NI22 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCFD2Q8NI22 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCFD2Q8NI22 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MCFD2Q8NI22 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MCFD2Q8NI22 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MCFD2Q8NI22 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MCFD2Q8NI22 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MCFD2Q8NI22 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MCFD2Q8NI22 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MCFD2Q8NI22 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MCFD2Q8NI22 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MCFD2Q8NI22 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MCFD2Q8NI22 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MCFD2Q8NI22 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MCFD2Q8NI22 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MCFD2Q8NI22 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MCFD2Q8NI22 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MCFD2Q8NI22 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MCFD2Q8NI22 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MCFD2Q8NI22 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MCFD2Q8NI22 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCFD2Q8NI22 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCFD2Q8NI22 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCFD2Q8NI22 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCFD2Q8NI22 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCFD2Q8NI22 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCFD2Q8NI22 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MCFD2Q8NI22 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCFD2Q8NI22 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MCFD2Q8NI22 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MCFD2Q8NI22 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCFD2Q8NI22 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCFD2Q8NI22 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCFD2Q8NI22 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCFD2Q8NI22 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCFD2Q8NI22 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MCFD2Q8NI22 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MCFD2Q8NI22 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MCFD2Q8NI22 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCFD2Q8NI22 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MCFD2Q8NI22 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MCFD2Q8NI22 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCFD2Q8NI22 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms