Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SVIPQ8NHG7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SVIPQ8NHG7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVIPQ8NHG7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms