Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG27

PJA1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA1Q8NG27 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PJA1Q8NG27 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PJA1Q8NG27 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PJA1Q8NG27 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PJA1Q8NG27 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PJA1Q8NG27 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PJA1Q8NG27 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PJA1Q8NG27 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PJA1Q8NG27 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PJA1Q8NG27 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PJA1Q8NG27 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PJA1Q8NG27 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PJA1Q8NG27 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PJA1Q8NG27 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PJA1Q8NG27 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PJA1Q8NG27 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PJA1Q8NG27 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PJA1Q8NG27 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PJA1Q8NG27 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PJA1Q8NG27 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PJA1Q8NG27 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PJA1Q8NG27 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PJA1Q8NG27 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PJA1Q8NG27 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PJA1Q8NG27 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PJA1Q8NG27 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PJA1Q8NG27 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PJA1Q8NG27 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PJA1Q8NG27 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PJA1Q8NG27 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PJA1Q8NG27 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PJA1Q8NG27 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PJA1Q8NG27 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PJA1Q8NG27 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PJA1Q8NG27 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PJA1Q8NG27 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PJA1Q8NG27 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PJA1Q8NG27 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PJA1Q8NG27 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PJA1Q8NG27 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PJA1Q8NG27 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PJA1Q8NG27 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PJA1Q8NG27 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PJA1Q8NG27 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PJA1Q8NG27 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PJA1Q8NG27 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PJA1Q8NG27 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PJA1Q8NG27 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PJA1Q8NG27 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PJA1Q8NG27 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PJA1Q8NG27 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PJA1Q8NG27 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PJA1Q8NG27 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PJA1Q8NG27 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PJA1Q8NG27 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PJA1Q8NG27 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PJA1Q8NG27 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PJA1Q8NG27 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PJA1Q8NG27 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PJA1Q8NG27 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PJA1Q8NG27 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PJA1Q8NG27 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PJA1Q8NG27 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PJA1Q8NG27 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PJA1Q8NG27 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PJA1Q8NG27 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PJA1Q8NG27 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PJA1Q8NG27 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PJA1Q8NG27 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PJA1Q8NG27 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PJA1Q8NG27 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PJA1Q8NG27 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PJA1Q8NG27 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PJA1Q8NG27 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PJA1Q8NG27 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PJA1Q8NG27 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PJA1Q8NG27 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PJA1Q8NG27 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PJA1Q8NG27 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PJA1Q8NG27 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PJA1Q8NG27 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PJA1Q8NG27 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PJA1Q8NG27 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PJA1Q8NG27 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PJA1Q8NG27 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PJA1Q8NG27 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PJA1Q8NG27 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PJA1Q8NG27 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PJA1Q8NG27 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PJA1Q8NG27 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PJA1Q8NG27 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PJA1Q8NG27 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PJA1Q8NG27 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PJA1Q8NG27 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PJA1Q8NG27 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PJA1Q8NG27 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PJA1Q8NG27 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PJA1Q8NG27 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PJA1Q8NG27 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PJA1Q8NG27 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms