Protein–RNA interactions for Protein: Q8NER1

TRPV1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV1Q8NER1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRPV1Q8NER1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRPV1Q8NER1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRPV1Q8NER1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRPV1Q8NER1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRPV1Q8NER1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRPV1Q8NER1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRPV1Q8NER1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TRPV1Q8NER1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRPV1Q8NER1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRPV1Q8NER1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRPV1Q8NER1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRPV1Q8NER1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRPV1Q8NER1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRPV1Q8NER1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRPV1Q8NER1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRPV1Q8NER1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRPV1Q8NER1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRPV1Q8NER1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRPV1Q8NER1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRPV1Q8NER1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRPV1Q8NER1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRPV1Q8NER1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRPV1Q8NER1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRPV1Q8NER1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRPV1Q8NER1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRPV1Q8NER1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRPV1Q8NER1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRPV1Q8NER1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TRPV1Q8NER1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRPV1Q8NER1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRPV1Q8NER1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRPV1Q8NER1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRPV1Q8NER1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRPV1Q8NER1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRPV1Q8NER1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRPV1Q8NER1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRPV1Q8NER1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRPV1Q8NER1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRPV1Q8NER1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRPV1Q8NER1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRPV1Q8NER1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRPV1Q8NER1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRPV1Q8NER1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRPV1Q8NER1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRPV1Q8NER1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRPV1Q8NER1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRPV1Q8NER1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRPV1Q8NER1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRPV1Q8NER1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRPV1Q8NER1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TRPV1Q8NER1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRPV1Q8NER1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRPV1Q8NER1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRPV1Q8NER1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRPV1Q8NER1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRPV1Q8NER1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRPV1Q8NER1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRPV1Q8NER1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRPV1Q8NER1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TRPV1Q8NER1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TRPV1Q8NER1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRPV1Q8NER1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TRPV1Q8NER1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TRPV1Q8NER1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRPV1Q8NER1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRPV1Q8NER1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRPV1Q8NER1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRPV1Q8NER1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRPV1Q8NER1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRPV1Q8NER1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRPV1Q8NER1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TRPV1Q8NER1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRPV1Q8NER1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRPV1Q8NER1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
TRPV1Q8NER1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRPV1Q8NER1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRPV1Q8NER1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRPV1Q8NER1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TRPV1Q8NER1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TRPV1Q8NER1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRPV1Q8NER1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRPV1Q8NER1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRPV1Q8NER1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRPV1Q8NER1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRPV1Q8NER1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRPV1Q8NER1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRPV1Q8NER1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRPV1Q8NER1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRPV1Q8NER1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRPV1Q8NER1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TRPV1Q8NER1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TRPV1Q8NER1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TRPV1Q8NER1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TRPV1Q8NER1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRPV1Q8NER1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRPV1Q8NER1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRPV1Q8NER1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRPV1Q8NER1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRPV1Q8NER1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms