Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM0

MCPH1, Microcephalin, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCPH1Q8NEM0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCPH1Q8NEM0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCPH1Q8NEM0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCPH1Q8NEM0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCPH1Q8NEM0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCPH1Q8NEM0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCPH1Q8NEM0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MCPH1Q8NEM0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MCPH1Q8NEM0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCPH1Q8NEM0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MCPH1Q8NEM0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCPH1Q8NEM0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MCPH1Q8NEM0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCPH1Q8NEM0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCPH1Q8NEM0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MCPH1Q8NEM0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCPH1Q8NEM0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCPH1Q8NEM0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MCPH1Q8NEM0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MCPH1Q8NEM0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCPH1Q8NEM0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCPH1Q8NEM0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCPH1Q8NEM0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCPH1Q8NEM0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCPH1Q8NEM0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCPH1Q8NEM0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MCPH1Q8NEM0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MCPH1Q8NEM0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCPH1Q8NEM0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCPH1Q8NEM0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCPH1Q8NEM0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCPH1Q8NEM0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCPH1Q8NEM0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCPH1Q8NEM0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
MCPH1Q8NEM0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCPH1Q8NEM0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MCPH1Q8NEM0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCPH1Q8NEM0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCPH1Q8NEM0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCPH1Q8NEM0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCPH1Q8NEM0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCPH1Q8NEM0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
MCPH1Q8NEM0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MCPH1Q8NEM0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCPH1Q8NEM0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCPH1Q8NEM0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCPH1Q8NEM0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCPH1Q8NEM0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCPH1Q8NEM0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCPH1Q8NEM0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MCPH1Q8NEM0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCPH1Q8NEM0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCPH1Q8NEM0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCPH1Q8NEM0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MCPH1Q8NEM0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCPH1Q8NEM0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MCPH1Q8NEM0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCPH1Q8NEM0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCPH1Q8NEM0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCPH1Q8NEM0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MCPH1Q8NEM0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCPH1Q8NEM0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCPH1Q8NEM0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCPH1Q8NEM0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCPH1Q8NEM0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MCPH1Q8NEM0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MCPH1Q8NEM0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MCPH1Q8NEM0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MCPH1Q8NEM0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MCPH1Q8NEM0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MCPH1Q8NEM0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MCPH1Q8NEM0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MCPH1Q8NEM0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MCPH1Q8NEM0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MCPH1Q8NEM0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MCPH1Q8NEM0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
MCPH1Q8NEM0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MCPH1Q8NEM0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MCPH1Q8NEM0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MCPH1Q8NEM0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MCPH1Q8NEM0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MCPH1Q8NEM0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MCPH1Q8NEM0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
MCPH1Q8NEM0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MCPH1Q8NEM0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MCPH1Q8NEM0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MCPH1Q8NEM0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MCPH1Q8NEM0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MCPH1Q8NEM0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MCPH1Q8NEM0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
MCPH1Q8NEM0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MCPH1Q8NEM0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MCPH1Q8NEM0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MCPH1Q8NEM0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MCPH1Q8NEM0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MCPH1Q8NEM0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
MCPH1Q8NEM0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MCPH1Q8NEM0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MCPH1Q8NEM0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MCPH1Q8NEM0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.4 ms