Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEG2

C7orf57, Uncharacterized protein C7orf57, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf57Q8NEG2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C7orf57Q8NEG2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C7orf57Q8NEG2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C7orf57Q8NEG2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C7orf57Q8NEG2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C7orf57Q8NEG2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C7orf57Q8NEG2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C7orf57Q8NEG2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C7orf57Q8NEG2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C7orf57Q8NEG2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C7orf57Q8NEG2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C7orf57Q8NEG2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C7orf57Q8NEG2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C7orf57Q8NEG2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C7orf57Q8NEG2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C7orf57Q8NEG2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C7orf57Q8NEG2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C7orf57Q8NEG2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C7orf57Q8NEG2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C7orf57Q8NEG2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C7orf57Q8NEG2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C7orf57Q8NEG2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C7orf57Q8NEG2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C7orf57Q8NEG2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C7orf57Q8NEG2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C7orf57Q8NEG2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C7orf57Q8NEG2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C7orf57Q8NEG2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C7orf57Q8NEG2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C7orf57Q8NEG2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C7orf57Q8NEG2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C7orf57Q8NEG2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C7orf57Q8NEG2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C7orf57Q8NEG2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C7orf57Q8NEG2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C7orf57Q8NEG2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C7orf57Q8NEG2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C7orf57Q8NEG2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C7orf57Q8NEG2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C7orf57Q8NEG2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C7orf57Q8NEG2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C7orf57Q8NEG2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C7orf57Q8NEG2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C7orf57Q8NEG2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms