Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB49

ATP11C, Phospholipid-transporting ATPase IG, humanhuman

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11CQ8NB49 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP11CQ8NB49 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP11CQ8NB49 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP11CQ8NB49 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms