Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTD1Q8N815 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTD1Q8N815 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTD1Q8N815 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTD1Q8N815 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTD1Q8N815 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTD1Q8N815 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTD1Q8N815 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTD1Q8N815 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTD1Q8N815 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTD1Q8N815 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTD1Q8N815 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTD1Q8N815 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTD1Q8N815 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTD1Q8N815 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTD1Q8N815 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTD1Q8N815 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTD1Q8N815 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTD1Q8N815 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTD1Q8N815 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTD1Q8N815 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTD1Q8N815 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTD1Q8N815 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTD1Q8N815 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTD1Q8N815 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTD1Q8N815 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTD1Q8N815 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTD1Q8N815 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTD1Q8N815 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTD1Q8N815 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTD1Q8N815 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNTD1Q8N815 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTD1Q8N815 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTD1Q8N815 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTD1Q8N815 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTD1Q8N815 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTD1Q8N815 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTD1Q8N815 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTD1Q8N815 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTD1Q8N815 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTD1Q8N815 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTD1Q8N815 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTD1Q8N815 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTD1Q8N815 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTD1Q8N815 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTD1Q8N815 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTD1Q8N815 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTD1Q8N815 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTD1Q8N815 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTD1Q8N815 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTD1Q8N815 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTD1Q8N815 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTD1Q8N815 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTD1Q8N815 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTD1Q8N815 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTD1Q8N815 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTD1Q8N815 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTD1Q8N815 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTD1Q8N815 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTD1Q8N815 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTD1Q8N815 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTD1Q8N815 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTD1Q8N815 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTD1Q8N815 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTD1Q8N815 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTD1Q8N815 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTD1Q8N815 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTD1Q8N815 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTD1Q8N815 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTD1Q8N815 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTD1Q8N815 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTD1Q8N815 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTD1Q8N815 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTD1Q8N815 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTD1Q8N815 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTD1Q8N815 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTD1Q8N815 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTD1Q8N815 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTD1Q8N815 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTD1Q8N815 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTD1Q8N815 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTD1Q8N815 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTD1Q8N815 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTD1Q8N815 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTD1Q8N815 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTD1Q8N815 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTD1Q8N815 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTD1Q8N815 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTD1Q8N815 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTD1Q8N815 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTD1Q8N815 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTD1Q8N815 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTD1Q8N815 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTD1Q8N815 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTD1Q8N815 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTD1Q8N815 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTD1Q8N815 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTD1Q8N815 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTD1Q8N815 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTD1Q8N815 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms