Protein–RNA interactions for Protein: Q8N806

UBR7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR7Q8N806 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBR7Q8N806 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBR7Q8N806 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBR7Q8N806 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBR7Q8N806 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBR7Q8N806 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBR7Q8N806 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBR7Q8N806 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
UBR7Q8N806 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBR7Q8N806 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBR7Q8N806 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBR7Q8N806 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBR7Q8N806 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBR7Q8N806 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBR7Q8N806 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBR7Q8N806 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBR7Q8N806 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBR7Q8N806 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBR7Q8N806 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBR7Q8N806 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBR7Q8N806 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBR7Q8N806 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBR7Q8N806 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBR7Q8N806 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBR7Q8N806 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBR7Q8N806 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBR7Q8N806 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBR7Q8N806 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBR7Q8N806 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBR7Q8N806 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBR7Q8N806 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBR7Q8N806 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBR7Q8N806 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBR7Q8N806 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBR7Q8N806 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBR7Q8N806 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBR7Q8N806 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBR7Q8N806 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBR7Q8N806 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBR7Q8N806 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBR7Q8N806 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBR7Q8N806 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBR7Q8N806 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
UBR7Q8N806 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBR7Q8N806 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBR7Q8N806 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBR7Q8N806 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBR7Q8N806 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBR7Q8N806 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
UBR7Q8N806 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBR7Q8N806 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBR7Q8N806 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
UBR7Q8N806 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBR7Q8N806 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
UBR7Q8N806 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBR7Q8N806 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBR7Q8N806 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBR7Q8N806 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBR7Q8N806 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBR7Q8N806 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBR7Q8N806 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBR7Q8N806 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
UBR7Q8N806 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBR7Q8N806 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBR7Q8N806 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBR7Q8N806 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBR7Q8N806 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBR7Q8N806 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBR7Q8N806 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBR7Q8N806 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
UBR7Q8N806 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBR7Q8N806 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBR7Q8N806 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBR7Q8N806 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
UBR7Q8N806 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBR7Q8N806 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
UBR7Q8N806 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBR7Q8N806 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBR7Q8N806 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBR7Q8N806 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBR7Q8N806 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBR7Q8N806 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBR7Q8N806 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBR7Q8N806 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBR7Q8N806 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBR7Q8N806 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBR7Q8N806 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBR7Q8N806 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBR7Q8N806 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBR7Q8N806 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBR7Q8N806 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBR7Q8N806 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBR7Q8N806 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBR7Q8N806 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
UBR7Q8N806 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBR7Q8N806 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBR7Q8N806 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBR7Q8N806 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBR7Q8N806 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBR7Q8N806 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms