Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
IGSF1Q8N6C5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
IGSF1Q8N6C5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
IGSF1Q8N6C5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
IGSF1Q8N6C5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
IGSF1Q8N6C5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
IGSF1Q8N6C5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
IGSF1Q8N6C5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
IGSF1Q8N6C5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
IGSF1Q8N6C5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
IGSF1Q8N6C5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
IGSF1Q8N6C5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
IGSF1Q8N6C5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
IGSF1Q8N6C5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
IGSF1Q8N6C5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
IGSF1Q8N6C5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
IGSF1Q8N6C5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
IGSF1Q8N6C5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
IGSF1Q8N6C5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
IGSF1Q8N6C5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
IGSF1Q8N6C5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
IGSF1Q8N6C5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
IGSF1Q8N6C5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
IGSF1Q8N6C5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
IGSF1Q8N6C5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
IGSF1Q8N6C5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
IGSF1Q8N6C5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
IGSF1Q8N6C5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
IGSF1Q8N6C5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
IGSF1Q8N6C5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
IGSF1Q8N6C5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
IGSF1Q8N6C5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
IGSF1Q8N6C5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
IGSF1Q8N6C5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
IGSF1Q8N6C5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
IGSF1Q8N6C5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
IGSF1Q8N6C5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
IGSF1Q8N6C5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
IGSF1Q8N6C5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
IGSF1Q8N6C5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
IGSF1Q8N6C5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
IGSF1Q8N6C5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
IGSF1Q8N6C5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
IGSF1Q8N6C5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
IGSF1Q8N6C5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
IGSF1Q8N6C5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
IGSF1Q8N6C5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
IGSF1Q8N6C5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
IGSF1Q8N6C5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
IGSF1Q8N6C5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
IGSF1Q8N6C5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
IGSF1Q8N6C5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
IGSF1Q8N6C5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
IGSF1Q8N6C5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
IGSF1Q8N6C5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
IGSF1Q8N6C5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
IGSF1Q8N6C5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
IGSF1Q8N6C5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
IGSF1Q8N6C5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
IGSF1Q8N6C5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
IGSF1Q8N6C5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
IGSF1Q8N6C5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
IGSF1Q8N6C5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
IGSF1Q8N6C5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
IGSF1Q8N6C5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
IGSF1Q8N6C5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
IGSF1Q8N6C5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
IGSF1Q8N6C5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
IGSF1Q8N6C5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
IGSF1Q8N6C5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
IGSF1Q8N6C5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
IGSF1Q8N6C5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
IGSF1Q8N6C5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
IGSF1Q8N6C5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
IGSF1Q8N6C5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
IGSF1Q8N6C5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
IGSF1Q8N6C5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
IGSF1Q8N6C5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
IGSF1Q8N6C5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
IGSF1Q8N6C5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
IGSF1Q8N6C5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
IGSF1Q8N6C5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
IGSF1Q8N6C5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
IGSF1Q8N6C5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
IGSF1Q8N6C5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
IGSF1Q8N6C5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
IGSF1Q8N6C5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
IGSF1Q8N6C5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
IGSF1Q8N6C5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
IGSF1Q8N6C5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
IGSF1Q8N6C5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
IGSF1Q8N6C5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
IGSF1Q8N6C5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
IGSF1Q8N6C5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
IGSF1Q8N6C5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
IGSF1Q8N6C5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
IGSF1Q8N6C5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
IGSF1Q8N6C5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
IGSF1Q8N6C5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
IGSF1Q8N6C5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms