Protein–RNA interactions for Protein: Q8N567

ZCCHC9, Zinc finger CCHC domain-containing protein 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC9Q8N567 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZCCHC9Q8N567 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZCCHC9Q8N567 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZCCHC9Q8N567 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZCCHC9Q8N567 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZCCHC9Q8N567 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZCCHC9Q8N567 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZCCHC9Q8N567 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZCCHC9Q8N567 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZCCHC9Q8N567 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZCCHC9Q8N567 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZCCHC9Q8N567 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZCCHC9Q8N567 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZCCHC9Q8N567 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZCCHC9Q8N567 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZCCHC9Q8N567 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZCCHC9Q8N567 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZCCHC9Q8N567 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZCCHC9Q8N567 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZCCHC9Q8N567 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZCCHC9Q8N567 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZCCHC9Q8N567 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZCCHC9Q8N567 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZCCHC9Q8N567 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZCCHC9Q8N567 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZCCHC9Q8N567 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZCCHC9Q8N567 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZCCHC9Q8N567 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZCCHC9Q8N567 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ZCCHC9Q8N567 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZCCHC9Q8N567 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZCCHC9Q8N567 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZCCHC9Q8N567 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZCCHC9Q8N567 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZCCHC9Q8N567 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZCCHC9Q8N567 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZCCHC9Q8N567 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZCCHC9Q8N567 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZCCHC9Q8N567 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZCCHC9Q8N567 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZCCHC9Q8N567 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZCCHC9Q8N567 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZCCHC9Q8N567 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZCCHC9Q8N567 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZCCHC9Q8N567 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZCCHC9Q8N567 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ZCCHC9Q8N567 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZCCHC9Q8N567 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZCCHC9Q8N567 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZCCHC9Q8N567 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZCCHC9Q8N567 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZCCHC9Q8N567 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZCCHC9Q8N567 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZCCHC9Q8N567 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZCCHC9Q8N567 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZCCHC9Q8N567 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZCCHC9Q8N567 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZCCHC9Q8N567 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZCCHC9Q8N567 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZCCHC9Q8N567 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZCCHC9Q8N567 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZCCHC9Q8N567 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZCCHC9Q8N567 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZCCHC9Q8N567 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZCCHC9Q8N567 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZCCHC9Q8N567 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZCCHC9Q8N567 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZCCHC9Q8N567 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZCCHC9Q8N567 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ZCCHC9Q8N567 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZCCHC9Q8N567 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZCCHC9Q8N567 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZCCHC9Q8N567 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZCCHC9Q8N567 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZCCHC9Q8N567 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZCCHC9Q8N567 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ZCCHC9Q8N567 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZCCHC9Q8N567 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ZCCHC9Q8N567 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZCCHC9Q8N567 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZCCHC9Q8N567 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ZCCHC9Q8N567 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZCCHC9Q8N567 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZCCHC9Q8N567 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZCCHC9Q8N567 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZCCHC9Q8N567 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZCCHC9Q8N567 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZCCHC9Q8N567 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ZCCHC9Q8N567 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ZCCHC9Q8N567 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZCCHC9Q8N567 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZCCHC9Q8N567 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZCCHC9Q8N567 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZCCHC9Q8N567 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZCCHC9Q8N567 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZCCHC9Q8N567 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZCCHC9Q8N567 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZCCHC9Q8N567 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZCCHC9Q8N567 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZCCHC9Q8N567 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms