Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
VPS8Q8N3P4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
VPS8Q8N3P4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
VPS8Q8N3P4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
VPS8Q8N3P4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC37.85■■■■□ 3.65
VPS8Q8N3P4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
VPS8Q8N3P4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
VPS8Q8N3P4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
VPS8Q8N3P4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
VPS8Q8N3P4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
VPS8Q8N3P4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
VPS8Q8N3P4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
VPS8Q8N3P4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
VPS8Q8N3P4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.64
VPS8Q8N3P4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
VPS8Q8N3P4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
VPS8Q8N3P4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
VPS8Q8N3P4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
VPS8Q8N3P4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
VPS8Q8N3P4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
VPS8Q8N3P4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
VPS8Q8N3P4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
VPS8Q8N3P4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
VPS8Q8N3P4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
VPS8Q8N3P4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
VPS8Q8N3P4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
VPS8Q8N3P4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
VPS8Q8N3P4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
VPS8Q8N3P4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC37.78■■■■□ 3.64
VPS8Q8N3P4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC37.78■■■■□ 3.64
VPS8Q8N3P4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
VPS8Q8N3P4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
VPS8Q8N3P4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
VPS8Q8N3P4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
VPS8Q8N3P4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
VPS8Q8N3P4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.64
VPS8Q8N3P4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
VPS8Q8N3P4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.63
VPS8Q8N3P4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
VPS8Q8N3P4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
VPS8Q8N3P4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
VPS8Q8N3P4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
VPS8Q8N3P4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
VPS8Q8N3P4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
VPS8Q8N3P4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
VPS8Q8N3P4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
VPS8Q8N3P4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
VPS8Q8N3P4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
VPS8Q8N3P4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
VPS8Q8N3P4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
VPS8Q8N3P4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
VPS8Q8N3P4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
VPS8Q8N3P4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
VPS8Q8N3P4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
VPS8Q8N3P4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
VPS8Q8N3P4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
VPS8Q8N3P4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
VPS8Q8N3P4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
VPS8Q8N3P4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
VPS8Q8N3P4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
VPS8Q8N3P4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
VPS8Q8N3P4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
VPS8Q8N3P4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
VPS8Q8N3P4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
VPS8Q8N3P4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.62
VPS8Q8N3P4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.62
VPS8Q8N3P4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC37.7■■■■□ 3.62
VPS8Q8N3P4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
VPS8Q8N3P4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
VPS8Q8N3P4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
VPS8Q8N3P4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
VPS8Q8N3P4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
VPS8Q8N3P4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
VPS8Q8N3P4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
VPS8Q8N3P4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
VPS8Q8N3P4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
VPS8Q8N3P4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
VPS8Q8N3P4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
VPS8Q8N3P4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
VPS8Q8N3P4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
VPS8Q8N3P4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
VPS8Q8N3P4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
VPS8Q8N3P4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
VPS8Q8N3P4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
VPS8Q8N3P4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
VPS8Q8N3P4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
VPS8Q8N3P4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
VPS8Q8N3P4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
VPS8Q8N3P4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
VPS8Q8N3P4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
VPS8Q8N3P4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
VPS8Q8N3P4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
VPS8Q8N3P4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
VPS8Q8N3P4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
VPS8Q8N3P4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
VPS8Q8N3P4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
VPS8Q8N3P4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
VPS8Q8N3P4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
VPS8Q8N3P4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
VPS8Q8N3P4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms