Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GPC2Q8N158 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GPC2Q8N158 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GPC2Q8N158 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GPC2Q8N158 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GPC2Q8N158 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GPC2Q8N158 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GPC2Q8N158 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GPC2Q8N158 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
GPC2Q8N158 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GPC2Q8N158 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GPC2Q8N158 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GPC2Q8N158 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
GPC2Q8N158 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GPC2Q8N158 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GPC2Q8N158 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GPC2Q8N158 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GPC2Q8N158 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GPC2Q8N158 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GPC2Q8N158 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GPC2Q8N158 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GPC2Q8N158 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GPC2Q8N158 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GPC2Q8N158 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GPC2Q8N158 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GPC2Q8N158 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GPC2Q8N158 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GPC2Q8N158 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GPC2Q8N158 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GPC2Q8N158 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GPC2Q8N158 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GPC2Q8N158 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPC2Q8N158 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
GPC2Q8N158 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPC2Q8N158 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPC2Q8N158 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPC2Q8N158 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPC2Q8N158 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPC2Q8N158 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GPC2Q8N158 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GPC2Q8N158 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GPC2Q8N158 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GPC2Q8N158 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GPC2Q8N158 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GPC2Q8N158 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GPC2Q8N158 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GPC2Q8N158 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GPC2Q8N158 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GPC2Q8N158 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GPC2Q8N158 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GPC2Q8N158 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
GPC2Q8N158 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GPC2Q8N158 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GPC2Q8N158 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GPC2Q8N158 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GPC2Q8N158 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
GPC2Q8N158 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GPC2Q8N158 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GPC2Q8N158 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GPC2Q8N158 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
GPC2Q8N158 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GPC2Q8N158 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GPC2Q8N158 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GPC2Q8N158 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GPC2Q8N158 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GPC2Q8N158 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GPC2Q8N158 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GPC2Q8N158 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
GPC2Q8N158 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GPC2Q8N158 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GPC2Q8N158 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
GPC2Q8N158 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GPC2Q8N158 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GPC2Q8N158 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GPC2Q8N158 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
GPC2Q8N158 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GPC2Q8N158 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
GPC2Q8N158 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GPC2Q8N158 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GPC2Q8N158 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GPC2Q8N158 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GPC2Q8N158 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GPC2Q8N158 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GPC2Q8N158 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GPC2Q8N158 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GPC2Q8N158 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GPC2Q8N158 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GPC2Q8N158 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GPC2Q8N158 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GPC2Q8N158 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GPC2Q8N158 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GPC2Q8N158 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GPC2Q8N158 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GPC2Q8N158 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GPC2Q8N158 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GPC2Q8N158 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GPC2Q8N158 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GPC2Q8N158 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GPC2Q8N158 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GPC2Q8N158 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms