Protein–RNA interactions for Protein: Q8N145

LGI3, Leucine-rich repeat LGI family member 3, humanhuman

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Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI3Q8N145 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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LGI3Q8N145 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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LGI3Q8N145 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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LGI3Q8N145 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
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LGI3Q8N145 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LGI3Q8N145 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LGI3Q8N145 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LGI3Q8N145 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LGI3Q8N145 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LGI3Q8N145 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LGI3Q8N145 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LGI3Q8N145 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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