Protein–RNA interactions for Protein: Q8N140

EID3, EP300-interacting inhibitor of differentiation 3, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EID3Q8N140 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EID3Q8N140 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EID3Q8N140 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EID3Q8N140 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EID3Q8N140 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EID3Q8N140 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EID3Q8N140 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EID3Q8N140 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EID3Q8N140 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EID3Q8N140 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EID3Q8N140 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EID3Q8N140 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EID3Q8N140 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EID3Q8N140 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EID3Q8N140 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EID3Q8N140 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EID3Q8N140 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EID3Q8N140 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EID3Q8N140 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EID3Q8N140 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EID3Q8N140 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EID3Q8N140 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EID3Q8N140 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EID3Q8N140 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EID3Q8N140 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EID3Q8N140 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EID3Q8N140 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EID3Q8N140 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EID3Q8N140 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EID3Q8N140 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms