Protein–RNA interactions for Protein: Q8N118

CYP4X1, Cytochrome P450 4X1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4X1Q8N118 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP4X1Q8N118 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP4X1Q8N118 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP4X1Q8N118 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP4X1Q8N118 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP4X1Q8N118 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP4X1Q8N118 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP4X1Q8N118 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP4X1Q8N118 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYP4X1Q8N118 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP4X1Q8N118 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP4X1Q8N118 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP4X1Q8N118 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP4X1Q8N118 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP4X1Q8N118 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP4X1Q8N118 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP4X1Q8N118 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP4X1Q8N118 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP4X1Q8N118 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP4X1Q8N118 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP4X1Q8N118 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
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CYP4X1Q8N118 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP4X1Q8N118 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP4X1Q8N118 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP4X1Q8N118 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP4X1Q8N118 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP4X1Q8N118 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP4X1Q8N118 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP4X1Q8N118 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP4X1Q8N118 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP4X1Q8N118 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP4X1Q8N118 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP4X1Q8N118 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP4X1Q8N118 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP4X1Q8N118 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYP4X1Q8N118 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYP4X1Q8N118 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYP4X1Q8N118 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CYP4X1Q8N118 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CYP4X1Q8N118 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CYP4X1Q8N118 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYP4X1Q8N118 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYP4X1Q8N118 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
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