Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXH7

NELFCD, Negative elongation factor C/D, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCDQ8IXH7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NELFCDQ8IXH7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NELFCDQ8IXH7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NELFCDQ8IXH7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NELFCDQ8IXH7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NELFCDQ8IXH7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NELFCDQ8IXH7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NELFCDQ8IXH7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NELFCDQ8IXH7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NELFCDQ8IXH7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NELFCDQ8IXH7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NELFCDQ8IXH7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NELFCDQ8IXH7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NELFCDQ8IXH7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NELFCDQ8IXH7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NELFCDQ8IXH7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NELFCDQ8IXH7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NELFCDQ8IXH7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NELFCDQ8IXH7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NELFCDQ8IXH7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NELFCDQ8IXH7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NELFCDQ8IXH7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NELFCDQ8IXH7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NELFCDQ8IXH7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NELFCDQ8IXH7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NELFCDQ8IXH7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
NELFCDQ8IXH7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NELFCDQ8IXH7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NELFCDQ8IXH7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NELFCDQ8IXH7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NELFCDQ8IXH7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NELFCDQ8IXH7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NELFCDQ8IXH7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NELFCDQ8IXH7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NELFCDQ8IXH7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NELFCDQ8IXH7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NELFCDQ8IXH7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NELFCDQ8IXH7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NELFCDQ8IXH7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NELFCDQ8IXH7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NELFCDQ8IXH7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NELFCDQ8IXH7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NELFCDQ8IXH7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NELFCDQ8IXH7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NELFCDQ8IXH7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NELFCDQ8IXH7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NELFCDQ8IXH7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NELFCDQ8IXH7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NELFCDQ8IXH7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NELFCDQ8IXH7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NELFCDQ8IXH7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NELFCDQ8IXH7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NELFCDQ8IXH7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NELFCDQ8IXH7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NELFCDQ8IXH7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NELFCDQ8IXH7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NELFCDQ8IXH7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NELFCDQ8IXH7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NELFCDQ8IXH7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NELFCDQ8IXH7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NELFCDQ8IXH7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NELFCDQ8IXH7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NELFCDQ8IXH7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NELFCDQ8IXH7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NELFCDQ8IXH7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NELFCDQ8IXH7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NELFCDQ8IXH7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NELFCDQ8IXH7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NELFCDQ8IXH7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NELFCDQ8IXH7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NELFCDQ8IXH7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NELFCDQ8IXH7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NELFCDQ8IXH7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NELFCDQ8IXH7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NELFCDQ8IXH7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NELFCDQ8IXH7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NELFCDQ8IXH7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NELFCDQ8IXH7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NELFCDQ8IXH7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NELFCDQ8IXH7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NELFCDQ8IXH7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NELFCDQ8IXH7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NELFCDQ8IXH7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NELFCDQ8IXH7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NELFCDQ8IXH7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NELFCDQ8IXH7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NELFCDQ8IXH7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NELFCDQ8IXH7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NELFCDQ8IXH7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NELFCDQ8IXH7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NELFCDQ8IXH7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NELFCDQ8IXH7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NELFCDQ8IXH7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NELFCDQ8IXH7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NELFCDQ8IXH7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NELFCDQ8IXH7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NELFCDQ8IXH7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NELFCDQ8IXH7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NELFCDQ8IXH7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NELFCDQ8IXH7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.9 ms