Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWQ3

BRSK2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK2Q8IWQ3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRSK2Q8IWQ3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRSK2Q8IWQ3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRSK2Q8IWQ3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRSK2Q8IWQ3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRSK2Q8IWQ3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRSK2Q8IWQ3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRSK2Q8IWQ3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRSK2Q8IWQ3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRSK2Q8IWQ3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRSK2Q8IWQ3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRSK2Q8IWQ3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRSK2Q8IWQ3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRSK2Q8IWQ3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRSK2Q8IWQ3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRSK2Q8IWQ3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRSK2Q8IWQ3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRSK2Q8IWQ3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRSK2Q8IWQ3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRSK2Q8IWQ3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRSK2Q8IWQ3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRSK2Q8IWQ3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRSK2Q8IWQ3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
BRSK2Q8IWQ3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRSK2Q8IWQ3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRSK2Q8IWQ3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRSK2Q8IWQ3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRSK2Q8IWQ3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRSK2Q8IWQ3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRSK2Q8IWQ3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRSK2Q8IWQ3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRSK2Q8IWQ3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRSK2Q8IWQ3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
BRSK2Q8IWQ3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
BRSK2Q8IWQ3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRSK2Q8IWQ3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRSK2Q8IWQ3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRSK2Q8IWQ3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRSK2Q8IWQ3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRSK2Q8IWQ3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRSK2Q8IWQ3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRSK2Q8IWQ3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
BRSK2Q8IWQ3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRSK2Q8IWQ3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRSK2Q8IWQ3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRSK2Q8IWQ3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRSK2Q8IWQ3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRSK2Q8IWQ3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRSK2Q8IWQ3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms