Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKL3Q8IVW4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKL3Q8IVW4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKL3Q8IVW4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKL3Q8IVW4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKL3Q8IVW4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKL3Q8IVW4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKL3Q8IVW4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKL3Q8IVW4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKL3Q8IVW4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKL3Q8IVW4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKL3Q8IVW4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKL3Q8IVW4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDKL3Q8IVW4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKL3Q8IVW4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKL3Q8IVW4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKL3Q8IVW4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKL3Q8IVW4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKL3Q8IVW4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKL3Q8IVW4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKL3Q8IVW4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKL3Q8IVW4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKL3Q8IVW4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKL3Q8IVW4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKL3Q8IVW4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKL3Q8IVW4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKL3Q8IVW4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDKL3Q8IVW4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKL3Q8IVW4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKL3Q8IVW4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKL3Q8IVW4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKL3Q8IVW4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKL3Q8IVW4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKL3Q8IVW4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKL3Q8IVW4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKL3Q8IVW4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKL3Q8IVW4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKL3Q8IVW4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKL3Q8IVW4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKL3Q8IVW4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKL3Q8IVW4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKL3Q8IVW4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKL3Q8IVW4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKL3Q8IVW4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKL3Q8IVW4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKL3Q8IVW4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKL3Q8IVW4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKL3Q8IVW4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKL3Q8IVW4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKL3Q8IVW4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKL3Q8IVW4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKL3Q8IVW4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKL3Q8IVW4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKL3Q8IVW4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDKL3Q8IVW4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDKL3Q8IVW4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDKL3Q8IVW4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDKL3Q8IVW4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDKL3Q8IVW4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKL3Q8IVW4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKL3Q8IVW4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKL3Q8IVW4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CDKL3Q8IVW4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDKL3Q8IVW4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDKL3Q8IVW4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDKL3Q8IVW4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDKL3Q8IVW4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CDKL3Q8IVW4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDKL3Q8IVW4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDKL3Q8IVW4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDKL3Q8IVW4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDKL3Q8IVW4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDKL3Q8IVW4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDKL3Q8IVW4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDKL3Q8IVW4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDKL3Q8IVW4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CDKL3Q8IVW4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDKL3Q8IVW4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDKL3Q8IVW4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDKL3Q8IVW4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDKL3Q8IVW4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDKL3Q8IVW4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDKL3Q8IVW4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDKL3Q8IVW4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDKL3Q8IVW4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDKL3Q8IVW4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDKL3Q8IVW4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDKL3Q8IVW4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDKL3Q8IVW4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms