Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV76

PASD1, Circadian clock protein PASD1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PASD1Q8IV76 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PASD1Q8IV76 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PASD1Q8IV76 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PASD1Q8IV76 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PASD1Q8IV76 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PASD1Q8IV76 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PASD1Q8IV76 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PASD1Q8IV76 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PASD1Q8IV76 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PASD1Q8IV76 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PASD1Q8IV76 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PASD1Q8IV76 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PASD1Q8IV76 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PASD1Q8IV76 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PASD1Q8IV76 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PASD1Q8IV76 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PASD1Q8IV76 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PASD1Q8IV76 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PASD1Q8IV76 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PASD1Q8IV76 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PASD1Q8IV76 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PASD1Q8IV76 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PASD1Q8IV76 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PASD1Q8IV76 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PASD1Q8IV76 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PASD1Q8IV76 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PASD1Q8IV76 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PASD1Q8IV76 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PASD1Q8IV76 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PASD1Q8IV76 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PASD1Q8IV76 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PASD1Q8IV76 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PASD1Q8IV76 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PASD1Q8IV76 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PASD1Q8IV76 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PASD1Q8IV76 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PASD1Q8IV76 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PASD1Q8IV76 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PASD1Q8IV76 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PASD1Q8IV76 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PASD1Q8IV76 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PASD1Q8IV76 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PASD1Q8IV76 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PASD1Q8IV76 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PASD1Q8IV76 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PASD1Q8IV76 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PASD1Q8IV76 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PASD1Q8IV76 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PASD1Q8IV76 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PASD1Q8IV76 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PASD1Q8IV76 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PASD1Q8IV76 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PASD1Q8IV76 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PASD1Q8IV76 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PASD1Q8IV76 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PASD1Q8IV76 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PASD1Q8IV76 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PASD1Q8IV76 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PASD1Q8IV76 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PASD1Q8IV76 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PASD1Q8IV76 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PASD1Q8IV76 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PASD1Q8IV76 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PASD1Q8IV76 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PASD1Q8IV76 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PASD1Q8IV76 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PASD1Q8IV76 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PASD1Q8IV76 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PASD1Q8IV76 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PASD1Q8IV76 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PASD1Q8IV76 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PASD1Q8IV76 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PASD1Q8IV76 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PASD1Q8IV76 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PASD1Q8IV76 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PASD1Q8IV76 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PASD1Q8IV76 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PASD1Q8IV76 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PASD1Q8IV76 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PASD1Q8IV76 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PASD1Q8IV76 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PASD1Q8IV76 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PASD1Q8IV76 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PASD1Q8IV76 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PASD1Q8IV76 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PASD1Q8IV76 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PASD1Q8IV76 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PASD1Q8IV76 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PASD1Q8IV76 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PASD1Q8IV76 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PASD1Q8IV76 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PASD1Q8IV76 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PASD1Q8IV76 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PASD1Q8IV76 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PASD1Q8IV76 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PASD1Q8IV76 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PASD1Q8IV76 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PASD1Q8IV76 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PASD1Q8IV76 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms