Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK7

VSIG1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG1Q86XK7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VSIG1Q86XK7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VSIG1Q86XK7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VSIG1Q86XK7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
VSIG1Q86XK7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VSIG1Q86XK7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
VSIG1Q86XK7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VSIG1Q86XK7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VSIG1Q86XK7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VSIG1Q86XK7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VSIG1Q86XK7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VSIG1Q86XK7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VSIG1Q86XK7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VSIG1Q86XK7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VSIG1Q86XK7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VSIG1Q86XK7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VSIG1Q86XK7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
VSIG1Q86XK7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VSIG1Q86XK7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
VSIG1Q86XK7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
VSIG1Q86XK7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VSIG1Q86XK7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VSIG1Q86XK7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VSIG1Q86XK7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VSIG1Q86XK7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VSIG1Q86XK7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VSIG1Q86XK7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VSIG1Q86XK7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
VSIG1Q86XK7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VSIG1Q86XK7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VSIG1Q86XK7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VSIG1Q86XK7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VSIG1Q86XK7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
VSIG1Q86XK7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VSIG1Q86XK7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VSIG1Q86XK7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VSIG1Q86XK7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VSIG1Q86XK7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VSIG1Q86XK7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VSIG1Q86XK7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VSIG1Q86XK7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
VSIG1Q86XK7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VSIG1Q86XK7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VSIG1Q86XK7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VSIG1Q86XK7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VSIG1Q86XK7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VSIG1Q86XK7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VSIG1Q86XK7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VSIG1Q86XK7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VSIG1Q86XK7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VSIG1Q86XK7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VSIG1Q86XK7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VSIG1Q86XK7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
VSIG1Q86XK7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VSIG1Q86XK7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VSIG1Q86XK7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VSIG1Q86XK7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
VSIG1Q86XK7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VSIG1Q86XK7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VSIG1Q86XK7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VSIG1Q86XK7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VSIG1Q86XK7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VSIG1Q86XK7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VSIG1Q86XK7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VSIG1Q86XK7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VSIG1Q86XK7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VSIG1Q86XK7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VSIG1Q86XK7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VSIG1Q86XK7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VSIG1Q86XK7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VSIG1Q86XK7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VSIG1Q86XK7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VSIG1Q86XK7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VSIG1Q86XK7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VSIG1Q86XK7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VSIG1Q86XK7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VSIG1Q86XK7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VSIG1Q86XK7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VSIG1Q86XK7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VSIG1Q86XK7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VSIG1Q86XK7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VSIG1Q86XK7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VSIG1Q86XK7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VSIG1Q86XK7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VSIG1Q86XK7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VSIG1Q86XK7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VSIG1Q86XK7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
VSIG1Q86XK7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VSIG1Q86XK7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VSIG1Q86XK7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VSIG1Q86XK7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VSIG1Q86XK7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VSIG1Q86XK7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VSIG1Q86XK7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VSIG1Q86XK7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VSIG1Q86XK7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VSIG1Q86XK7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
VSIG1Q86XK7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VSIG1Q86XK7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
VSIG1Q86XK7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms