Protein–RNA interactions for Protein: Q86UB9

TMEM135, Transmembrane protein 135, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM135Q86UB9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM135Q86UB9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM135Q86UB9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM135Q86UB9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM135Q86UB9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM135Q86UB9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM135Q86UB9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM135Q86UB9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM135Q86UB9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM135Q86UB9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM135Q86UB9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM135Q86UB9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM135Q86UB9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM135Q86UB9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM135Q86UB9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM135Q86UB9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM135Q86UB9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM135Q86UB9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM135Q86UB9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM135Q86UB9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM135Q86UB9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM135Q86UB9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM135Q86UB9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM135Q86UB9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM135Q86UB9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM135Q86UB9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM135Q86UB9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM135Q86UB9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM135Q86UB9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM135Q86UB9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM135Q86UB9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM135Q86UB9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM135Q86UB9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM135Q86UB9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM135Q86UB9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM135Q86UB9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM135Q86UB9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM135Q86UB9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM135Q86UB9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM135Q86UB9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM135Q86UB9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM135Q86UB9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM135Q86UB9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM135Q86UB9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TMEM135Q86UB9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM135Q86UB9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM135Q86UB9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM135Q86UB9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM135Q86UB9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM135Q86UB9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM135Q86UB9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM135Q86UB9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM135Q86UB9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM135Q86UB9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM135Q86UB9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM135Q86UB9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM135Q86UB9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM135Q86UB9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM135Q86UB9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM135Q86UB9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM135Q86UB9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM135Q86UB9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM135Q86UB9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM135Q86UB9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM135Q86UB9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM135Q86UB9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM135Q86UB9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM135Q86UB9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM135Q86UB9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM135Q86UB9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM135Q86UB9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM135Q86UB9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM135Q86UB9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM135Q86UB9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM135Q86UB9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM135Q86UB9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM135Q86UB9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM135Q86UB9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM135Q86UB9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM135Q86UB9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM135Q86UB9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM135Q86UB9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM135Q86UB9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM135Q86UB9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM135Q86UB9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM135Q86UB9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM135Q86UB9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM135Q86UB9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM135Q86UB9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM135Q86UB9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM135Q86UB9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM135Q86UB9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM135Q86UB9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM135Q86UB9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM135Q86UB9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM135Q86UB9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM135Q86UB9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM135Q86UB9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM135Q86UB9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM135Q86UB9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms