Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLNKQ7Z7G1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLNKQ7Z7G1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLNKQ7Z7G1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLNKQ7Z7G1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLNKQ7Z7G1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLNKQ7Z7G1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLNKQ7Z7G1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLNKQ7Z7G1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CLNKQ7Z7G1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLNKQ7Z7G1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLNKQ7Z7G1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLNKQ7Z7G1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLNKQ7Z7G1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLNKQ7Z7G1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLNKQ7Z7G1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLNKQ7Z7G1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CLNKQ7Z7G1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLNKQ7Z7G1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLNKQ7Z7G1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLNKQ7Z7G1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLNKQ7Z7G1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLNKQ7Z7G1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLNKQ7Z7G1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLNKQ7Z7G1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLNKQ7Z7G1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLNKQ7Z7G1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLNKQ7Z7G1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLNKQ7Z7G1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms