Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX20Q7Z614 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX20Q7Z614 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX20Q7Z614 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX20Q7Z614 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX20Q7Z614 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX20Q7Z614 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX20Q7Z614 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX20Q7Z614 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX20Q7Z614 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX20Q7Z614 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX20Q7Z614 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX20Q7Z614 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX20Q7Z614 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX20Q7Z614 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX20Q7Z614 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX20Q7Z614 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX20Q7Z614 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX20Q7Z614 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX20Q7Z614 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX20Q7Z614 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX20Q7Z614 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX20Q7Z614 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX20Q7Z614 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX20Q7Z614 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX20Q7Z614 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX20Q7Z614 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX20Q7Z614 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX20Q7Z614 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX20Q7Z614 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX20Q7Z614 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX20Q7Z614 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX20Q7Z614 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX20Q7Z614 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX20Q7Z614 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX20Q7Z614 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX20Q7Z614 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNX20Q7Z614 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNX20Q7Z614 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNX20Q7Z614 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNX20Q7Z614 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX20Q7Z614 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX20Q7Z614 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX20Q7Z614 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX20Q7Z614 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX20Q7Z614 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX20Q7Z614 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX20Q7Z614 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX20Q7Z614 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX20Q7Z614 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX20Q7Z614 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX20Q7Z614 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX20Q7Z614 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX20Q7Z614 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX20Q7Z614 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX20Q7Z614 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX20Q7Z614 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX20Q7Z614 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX20Q7Z614 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX20Q7Z614 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX20Q7Z614 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX20Q7Z614 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX20Q7Z614 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX20Q7Z614 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX20Q7Z614 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX20Q7Z614 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX20Q7Z614 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX20Q7Z614 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX20Q7Z614 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX20Q7Z614 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX20Q7Z614 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX20Q7Z614 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX20Q7Z614 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX20Q7Z614 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX20Q7Z614 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX20Q7Z614 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX20Q7Z614 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX20Q7Z614 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX20Q7Z614 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX20Q7Z614 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX20Q7Z614 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX20Q7Z614 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms