Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B1

NEGR1, Neuronal growth regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEGR1Q7Z3B1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NEGR1Q7Z3B1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NEGR1Q7Z3B1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms