Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APTXQ7Z2E3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APTXQ7Z2E3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APTXQ7Z2E3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APTXQ7Z2E3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APTXQ7Z2E3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APTXQ7Z2E3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APTXQ7Z2E3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APTXQ7Z2E3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APTXQ7Z2E3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APTXQ7Z2E3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APTXQ7Z2E3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
APTXQ7Z2E3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
APTXQ7Z2E3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
APTXQ7Z2E3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APTXQ7Z2E3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APTXQ7Z2E3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APTXQ7Z2E3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
APTXQ7Z2E3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
APTXQ7Z2E3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
APTXQ7Z2E3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APTXQ7Z2E3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APTXQ7Z2E3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APTXQ7Z2E3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APTXQ7Z2E3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APTXQ7Z2E3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
APTXQ7Z2E3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APTXQ7Z2E3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
APTXQ7Z2E3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APTXQ7Z2E3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
APTXQ7Z2E3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APTXQ7Z2E3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APTXQ7Z2E3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APTXQ7Z2E3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
APTXQ7Z2E3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
APTXQ7Z2E3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
APTXQ7Z2E3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
APTXQ7Z2E3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
APTXQ7Z2E3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
APTXQ7Z2E3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
APTXQ7Z2E3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APTXQ7Z2E3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APTXQ7Z2E3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
APTXQ7Z2E3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
APTXQ7Z2E3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APTXQ7Z2E3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APTXQ7Z2E3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APTXQ7Z2E3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
APTXQ7Z2E3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APTXQ7Z2E3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APTXQ7Z2E3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APTXQ7Z2E3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
APTXQ7Z2E3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
APTXQ7Z2E3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APTXQ7Z2E3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APTXQ7Z2E3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APTXQ7Z2E3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
APTXQ7Z2E3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
APTXQ7Z2E3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APTXQ7Z2E3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APTXQ7Z2E3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APTXQ7Z2E3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APTXQ7Z2E3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
APTXQ7Z2E3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APTXQ7Z2E3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APTXQ7Z2E3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
APTXQ7Z2E3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
APTXQ7Z2E3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APTXQ7Z2E3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APTXQ7Z2E3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
APTXQ7Z2E3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
APTXQ7Z2E3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APTXQ7Z2E3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APTXQ7Z2E3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APTXQ7Z2E3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APTXQ7Z2E3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APTXQ7Z2E3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APTXQ7Z2E3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APTXQ7Z2E3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APTXQ7Z2E3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APTXQ7Z2E3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APTXQ7Z2E3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APTXQ7Z2E3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APTXQ7Z2E3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APTXQ7Z2E3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APTXQ7Z2E3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
APTXQ7Z2E3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APTXQ7Z2E3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APTXQ7Z2E3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APTXQ7Z2E3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APTXQ7Z2E3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APTXQ7Z2E3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APTXQ7Z2E3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APTXQ7Z2E3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APTXQ7Z2E3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APTXQ7Z2E3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APTXQ7Z2E3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APTXQ7Z2E3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APTXQ7Z2E3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
APTXQ7Z2E3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms