Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STRADAQ7RTN6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STRADAQ7RTN6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
STRADAQ7RTN6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
STRADAQ7RTN6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
STRADAQ7RTN6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRADAQ7RTN6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRADAQ7RTN6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRADAQ7RTN6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRADAQ7RTN6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
STRADAQ7RTN6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRADAQ7RTN6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRADAQ7RTN6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRADAQ7RTN6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRADAQ7RTN6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRADAQ7RTN6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRADAQ7RTN6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
STRADAQ7RTN6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRADAQ7RTN6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRADAQ7RTN6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRADAQ7RTN6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRADAQ7RTN6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRADAQ7RTN6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRADAQ7RTN6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRADAQ7RTN6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
STRADAQ7RTN6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRADAQ7RTN6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRADAQ7RTN6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRADAQ7RTN6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRADAQ7RTN6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRADAQ7RTN6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
STRADAQ7RTN6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
STRADAQ7RTN6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRADAQ7RTN6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
STRADAQ7RTN6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRADAQ7RTN6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRADAQ7RTN6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRADAQ7RTN6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRADAQ7RTN6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRADAQ7RTN6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRADAQ7RTN6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRADAQ7RTN6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRADAQ7RTN6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRADAQ7RTN6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRADAQ7RTN6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRADAQ7RTN6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRADAQ7RTN6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRADAQ7RTN6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRADAQ7RTN6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRADAQ7RTN6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRADAQ7RTN6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRADAQ7RTN6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRADAQ7RTN6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRADAQ7RTN6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRADAQ7RTN6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRADAQ7RTN6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRADAQ7RTN6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRADAQ7RTN6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
STRADAQ7RTN6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
STRADAQ7RTN6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
STRADAQ7RTN6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
STRADAQ7RTN6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
STRADAQ7RTN6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
STRADAQ7RTN6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
STRADAQ7RTN6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
STRADAQ7RTN6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRADAQ7RTN6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRADAQ7RTN6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRADAQ7RTN6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRADAQ7RTN6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRADAQ7RTN6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRADAQ7RTN6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRADAQ7RTN6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRADAQ7RTN6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRADAQ7RTN6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRADAQ7RTN6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRADAQ7RTN6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRADAQ7RTN6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
STRADAQ7RTN6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRADAQ7RTN6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRADAQ7RTN6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRADAQ7RTN6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRADAQ7RTN6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRADAQ7RTN6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRADAQ7RTN6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRADAQ7RTN6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRADAQ7RTN6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRADAQ7RTN6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRADAQ7RTN6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRADAQ7RTN6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRADAQ7RTN6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
STRADAQ7RTN6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRADAQ7RTN6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRADAQ7RTN6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRADAQ7RTN6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRADAQ7RTN6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRADAQ7RTN6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRADAQ7RTN6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRADAQ7RTN6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STRADAQ7RTN6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.7 ms