Protein–RNA interactions for Protein: Q7M4L6

SHF, SH2 domain-containing adapter protein F, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHFQ7M4L6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHFQ7M4L6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHFQ7M4L6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHFQ7M4L6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHFQ7M4L6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHFQ7M4L6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHFQ7M4L6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHFQ7M4L6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHFQ7M4L6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHFQ7M4L6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SHFQ7M4L6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHFQ7M4L6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHFQ7M4L6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHFQ7M4L6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHFQ7M4L6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHFQ7M4L6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHFQ7M4L6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHFQ7M4L6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHFQ7M4L6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHFQ7M4L6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHFQ7M4L6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHFQ7M4L6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHFQ7M4L6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHFQ7M4L6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SHFQ7M4L6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHFQ7M4L6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHFQ7M4L6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHFQ7M4L6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHFQ7M4L6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHFQ7M4L6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHFQ7M4L6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHFQ7M4L6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHFQ7M4L6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHFQ7M4L6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHFQ7M4L6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHFQ7M4L6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHFQ7M4L6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHFQ7M4L6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHFQ7M4L6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHFQ7M4L6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SHFQ7M4L6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SHFQ7M4L6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHFQ7M4L6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHFQ7M4L6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHFQ7M4L6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHFQ7M4L6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHFQ7M4L6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHFQ7M4L6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHFQ7M4L6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHFQ7M4L6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHFQ7M4L6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHFQ7M4L6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHFQ7M4L6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SHFQ7M4L6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SHFQ7M4L6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SHFQ7M4L6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SHFQ7M4L6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms