Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HS2ST1Q7LGA3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HS2ST1Q7LGA3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HS2ST1Q7LGA3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HS2ST1Q7LGA3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HS2ST1Q7LGA3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HS2ST1Q7LGA3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HS2ST1Q7LGA3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HS2ST1Q7LGA3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HS2ST1Q7LGA3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HS2ST1Q7LGA3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HS2ST1Q7LGA3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HS2ST1Q7LGA3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HS2ST1Q7LGA3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HS2ST1Q7LGA3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HS2ST1Q7LGA3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HS2ST1Q7LGA3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HS2ST1Q7LGA3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
HS2ST1Q7LGA3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HS2ST1Q7LGA3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HS2ST1Q7LGA3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HS2ST1Q7LGA3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HS2ST1Q7LGA3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HS2ST1Q7LGA3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HS2ST1Q7LGA3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HS2ST1Q7LGA3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HS2ST1Q7LGA3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HS2ST1Q7LGA3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HS2ST1Q7LGA3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HS2ST1Q7LGA3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HS2ST1Q7LGA3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
HS2ST1Q7LGA3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HS2ST1Q7LGA3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HS2ST1Q7LGA3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HS2ST1Q7LGA3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HS2ST1Q7LGA3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HS2ST1Q7LGA3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HS2ST1Q7LGA3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HS2ST1Q7LGA3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HS2ST1Q7LGA3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HS2ST1Q7LGA3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HS2ST1Q7LGA3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HS2ST1Q7LGA3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HS2ST1Q7LGA3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HS2ST1Q7LGA3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HS2ST1Q7LGA3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HS2ST1Q7LGA3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HS2ST1Q7LGA3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HS2ST1Q7LGA3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HS2ST1Q7LGA3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HS2ST1Q7LGA3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HS2ST1Q7LGA3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HS2ST1Q7LGA3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HS2ST1Q7LGA3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HS2ST1Q7LGA3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HS2ST1Q7LGA3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HS2ST1Q7LGA3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HS2ST1Q7LGA3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HS2ST1Q7LGA3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HS2ST1Q7LGA3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HS2ST1Q7LGA3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HS2ST1Q7LGA3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HS2ST1Q7LGA3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HS2ST1Q7LGA3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HS2ST1Q7LGA3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HS2ST1Q7LGA3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HS2ST1Q7LGA3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HS2ST1Q7LGA3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HS2ST1Q7LGA3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HS2ST1Q7LGA3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HS2ST1Q7LGA3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HS2ST1Q7LGA3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HS2ST1Q7LGA3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HS2ST1Q7LGA3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HS2ST1Q7LGA3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HS2ST1Q7LGA3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HS2ST1Q7LGA3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HS2ST1Q7LGA3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HS2ST1Q7LGA3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HS2ST1Q7LGA3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HS2ST1Q7LGA3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HS2ST1Q7LGA3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HS2ST1Q7LGA3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HS2ST1Q7LGA3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HS2ST1Q7LGA3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HS2ST1Q7LGA3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HS2ST1Q7LGA3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HS2ST1Q7LGA3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HS2ST1Q7LGA3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HS2ST1Q7LGA3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HS2ST1Q7LGA3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HS2ST1Q7LGA3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
HS2ST1Q7LGA3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HS2ST1Q7LGA3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HS2ST1Q7LGA3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HS2ST1Q7LGA3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HS2ST1Q7LGA3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HS2ST1Q7LGA3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HS2ST1Q7LGA3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HS2ST1Q7LGA3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms