Protein–RNA interactions for Protein: Q7LC44

ARC, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCQ7LC44 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARCQ7LC44 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARCQ7LC44 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARCQ7LC44 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARCQ7LC44 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARCQ7LC44 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ARCQ7LC44 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARCQ7LC44 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ARCQ7LC44 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARCQ7LC44 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ARCQ7LC44 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ARCQ7LC44 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARCQ7LC44 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ARCQ7LC44 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARCQ7LC44 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARCQ7LC44 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARCQ7LC44 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARCQ7LC44 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARCQ7LC44 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARCQ7LC44 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARCQ7LC44 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ARCQ7LC44 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARCQ7LC44 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARCQ7LC44 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARCQ7LC44 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARCQ7LC44 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARCQ7LC44 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ARCQ7LC44 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARCQ7LC44 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARCQ7LC44 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARCQ7LC44 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARCQ7LC44 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARCQ7LC44 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARCQ7LC44 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARCQ7LC44 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARCQ7LC44 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARCQ7LC44 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARCQ7LC44 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ARCQ7LC44 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARCQ7LC44 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARCQ7LC44 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARCQ7LC44 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARCQ7LC44 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARCQ7LC44 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ARCQ7LC44 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARCQ7LC44 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARCQ7LC44 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARCQ7LC44 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARCQ7LC44 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARCQ7LC44 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARCQ7LC44 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARCQ7LC44 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARCQ7LC44 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ARCQ7LC44 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ARCQ7LC44 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARCQ7LC44 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARCQ7LC44 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARCQ7LC44 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARCQ7LC44 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ARCQ7LC44 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARCQ7LC44 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARCQ7LC44 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARCQ7LC44 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ARCQ7LC44 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARCQ7LC44 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARCQ7LC44 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARCQ7LC44 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARCQ7LC44 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARCQ7LC44 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARCQ7LC44 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARCQ7LC44 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARCQ7LC44 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARCQ7LC44 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARCQ7LC44 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARCQ7LC44 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARCQ7LC44 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARCQ7LC44 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARCQ7LC44 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARCQ7LC44 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARCQ7LC44 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARCQ7LC44 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARCQ7LC44 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARCQ7LC44 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARCQ7LC44 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARCQ7LC44 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARCQ7LC44 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARCQ7LC44 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARCQ7LC44 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARCQ7LC44 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARCQ7LC44 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARCQ7LC44 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARCQ7LC44 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARCQ7LC44 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARCQ7LC44 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARCQ7LC44 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARCQ7LC44 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARCQ7LC44 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARCQ7LC44 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARCQ7LC44 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARCQ7LC44 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms