Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SV2AQ7L0J3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SV2AQ7L0J3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SV2AQ7L0J3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SV2AQ7L0J3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SV2AQ7L0J3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SV2AQ7L0J3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SV2AQ7L0J3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SV2AQ7L0J3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SV2AQ7L0J3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SV2AQ7L0J3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SV2AQ7L0J3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SV2AQ7L0J3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SV2AQ7L0J3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SV2AQ7L0J3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SV2AQ7L0J3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SV2AQ7L0J3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SV2AQ7L0J3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SV2AQ7L0J3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SV2AQ7L0J3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SV2AQ7L0J3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SV2AQ7L0J3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SV2AQ7L0J3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SV2AQ7L0J3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SV2AQ7L0J3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SV2AQ7L0J3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SV2AQ7L0J3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SV2AQ7L0J3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SV2AQ7L0J3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SV2AQ7L0J3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SV2AQ7L0J3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SV2AQ7L0J3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SV2AQ7L0J3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SV2AQ7L0J3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SV2AQ7L0J3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SV2AQ7L0J3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SV2AQ7L0J3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SV2AQ7L0J3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SV2AQ7L0J3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SV2AQ7L0J3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SV2AQ7L0J3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SV2AQ7L0J3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SV2AQ7L0J3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SV2AQ7L0J3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SV2AQ7L0J3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SV2AQ7L0J3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SV2AQ7L0J3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SV2AQ7L0J3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SV2AQ7L0J3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SV2AQ7L0J3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SV2AQ7L0J3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SV2AQ7L0J3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SV2AQ7L0J3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SV2AQ7L0J3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SV2AQ7L0J3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SV2AQ7L0J3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SV2AQ7L0J3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SV2AQ7L0J3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SV2AQ7L0J3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SV2AQ7L0J3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SV2AQ7L0J3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SV2AQ7L0J3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SV2AQ7L0J3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SV2AQ7L0J3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SV2AQ7L0J3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SV2AQ7L0J3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SV2AQ7L0J3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SV2AQ7L0J3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SV2AQ7L0J3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SV2AQ7L0J3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SV2AQ7L0J3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SV2AQ7L0J3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SV2AQ7L0J3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SV2AQ7L0J3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SV2AQ7L0J3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SV2AQ7L0J3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SV2AQ7L0J3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SV2AQ7L0J3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SV2AQ7L0J3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SV2AQ7L0J3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SV2AQ7L0J3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SV2AQ7L0J3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SV2AQ7L0J3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SV2AQ7L0J3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SV2AQ7L0J3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SV2AQ7L0J3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SV2AQ7L0J3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SV2AQ7L0J3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SV2AQ7L0J3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SV2AQ7L0J3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SV2AQ7L0J3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SV2AQ7L0J3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SV2AQ7L0J3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SV2AQ7L0J3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SV2AQ7L0J3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SV2AQ7L0J3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SV2AQ7L0J3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SV2AQ7L0J3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SV2AQ7L0J3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SV2AQ7L0J3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms