Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC80Q76M96 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC80Q76M96 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC80Q76M96 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC80Q76M96 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC80Q76M96 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC80Q76M96 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC80Q76M96 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC80Q76M96 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC80Q76M96 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC80Q76M96 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC80Q76M96 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC80Q76M96 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC80Q76M96 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC80Q76M96 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC80Q76M96 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC80Q76M96 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC80Q76M96 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC80Q76M96 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC80Q76M96 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC80Q76M96 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC80Q76M96 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC80Q76M96 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC80Q76M96 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC80Q76M96 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC80Q76M96 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC80Q76M96 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC80Q76M96 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC80Q76M96 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC80Q76M96 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC80Q76M96 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC80Q76M96 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC80Q76M96 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC80Q76M96 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC80Q76M96 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC80Q76M96 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC80Q76M96 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC80Q76M96 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC80Q76M96 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC80Q76M96 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC80Q76M96 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC80Q76M96 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC80Q76M96 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC80Q76M96 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC80Q76M96 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC80Q76M96 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC80Q76M96 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC80Q76M96 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC80Q76M96 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC80Q76M96 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC80Q76M96 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC80Q76M96 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC80Q76M96 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC80Q76M96 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC80Q76M96 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC80Q76M96 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC80Q76M96 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC80Q76M96 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC80Q76M96 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC80Q76M96 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC80Q76M96 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC80Q76M96 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC80Q76M96 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC80Q76M96 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC80Q76M96 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms