Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC129Q6ZRS4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC129Q6ZRS4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC129Q6ZRS4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC129Q6ZRS4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC129Q6ZRS4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC129Q6ZRS4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC129Q6ZRS4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC129Q6ZRS4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC129Q6ZRS4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC129Q6ZRS4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC129Q6ZRS4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC129Q6ZRS4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC129Q6ZRS4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC129Q6ZRS4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC129Q6ZRS4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC129Q6ZRS4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC129Q6ZRS4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC129Q6ZRS4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC129Q6ZRS4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC129Q6ZRS4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC129Q6ZRS4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC129Q6ZRS4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC129Q6ZRS4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC129Q6ZRS4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC129Q6ZRS4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC129Q6ZRS4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC129Q6ZRS4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC129Q6ZRS4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC129Q6ZRS4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC129Q6ZRS4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC129Q6ZRS4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC129Q6ZRS4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC129Q6ZRS4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC129Q6ZRS4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC129Q6ZRS4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC129Q6ZRS4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC129Q6ZRS4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC129Q6ZRS4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC129Q6ZRS4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC129Q6ZRS4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC129Q6ZRS4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC129Q6ZRS4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC129Q6ZRS4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC129Q6ZRS4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC129Q6ZRS4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC129Q6ZRS4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC129Q6ZRS4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC129Q6ZRS4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC129Q6ZRS4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC129Q6ZRS4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC129Q6ZRS4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC129Q6ZRS4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC129Q6ZRS4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC129Q6ZRS4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC129Q6ZRS4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC129Q6ZRS4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC129Q6ZRS4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC129Q6ZRS4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC129Q6ZRS4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC129Q6ZRS4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC129Q6ZRS4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC129Q6ZRS4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC129Q6ZRS4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC129Q6ZRS4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC129Q6ZRS4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC129Q6ZRS4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC129Q6ZRS4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC129Q6ZRS4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC129Q6ZRS4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC129Q6ZRS4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC129Q6ZRS4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC129Q6ZRS4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC129Q6ZRS4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC129Q6ZRS4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC129Q6ZRS4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC129Q6ZRS4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC129Q6ZRS4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC129Q6ZRS4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC129Q6ZRS4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC129Q6ZRS4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC129Q6ZRS4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC129Q6ZRS4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC129Q6ZRS4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC129Q6ZRS4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC129Q6ZRS4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC129Q6ZRS4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC129Q6ZRS4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC129Q6ZRS4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC129Q6ZRS4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC129Q6ZRS4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC129Q6ZRS4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC129Q6ZRS4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC129Q6ZRS4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC129Q6ZRS4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC129Q6ZRS4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC129Q6ZRS4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC129Q6ZRS4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC129Q6ZRS4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC129Q6ZRS4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms