Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SRCAPQ6ZRS2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SRCAPQ6ZRS2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
SRCAPQ6ZRS2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SRCAPQ6ZRS2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SRCAPQ6ZRS2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SRCAPQ6ZRS2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SRCAPQ6ZRS2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SRCAPQ6ZRS2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SRCAPQ6ZRS2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SRCAPQ6ZRS2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SRCAPQ6ZRS2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SRCAPQ6ZRS2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SRCAPQ6ZRS2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
SRCAPQ6ZRS2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SRCAPQ6ZRS2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SRCAPQ6ZRS2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SRCAPQ6ZRS2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SRCAPQ6ZRS2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SRCAPQ6ZRS2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SRCAPQ6ZRS2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SRCAPQ6ZRS2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SRCAPQ6ZRS2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SRCAPQ6ZRS2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SRCAPQ6ZRS2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SRCAPQ6ZRS2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SRCAPQ6ZRS2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SRCAPQ6ZRS2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SRCAPQ6ZRS2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SRCAPQ6ZRS2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SRCAPQ6ZRS2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SRCAPQ6ZRS2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SRCAPQ6ZRS2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
SRCAPQ6ZRS2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SRCAPQ6ZRS2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SRCAPQ6ZRS2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SRCAPQ6ZRS2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SRCAPQ6ZRS2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SRCAPQ6ZRS2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SRCAPQ6ZRS2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SRCAPQ6ZRS2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SRCAPQ6ZRS2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SRCAPQ6ZRS2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SRCAPQ6ZRS2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SRCAPQ6ZRS2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SRCAPQ6ZRS2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SRCAPQ6ZRS2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SRCAPQ6ZRS2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
SRCAPQ6ZRS2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SRCAPQ6ZRS2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SRCAPQ6ZRS2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SRCAPQ6ZRS2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SRCAPQ6ZRS2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SRCAPQ6ZRS2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
SRCAPQ6ZRS2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SRCAPQ6ZRS2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
SRCAPQ6ZRS2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SRCAPQ6ZRS2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SRCAPQ6ZRS2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
SRCAPQ6ZRS2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SRCAPQ6ZRS2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SRCAPQ6ZRS2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SRCAPQ6ZRS2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SRCAPQ6ZRS2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SRCAPQ6ZRS2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SRCAPQ6ZRS2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SRCAPQ6ZRS2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SRCAPQ6ZRS2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
SRCAPQ6ZRS2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
SRCAPQ6ZRS2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SRCAPQ6ZRS2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SRCAPQ6ZRS2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SRCAPQ6ZRS2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SRCAPQ6ZRS2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SRCAPQ6ZRS2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SRCAPQ6ZRS2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SRCAPQ6ZRS2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SRCAPQ6ZRS2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SRCAPQ6ZRS2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SRCAPQ6ZRS2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SRCAPQ6ZRS2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SRCAPQ6ZRS2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SRCAPQ6ZRS2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SRCAPQ6ZRS2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SRCAPQ6ZRS2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SRCAPQ6ZRS2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SRCAPQ6ZRS2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SRCAPQ6ZRS2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SRCAPQ6ZRS2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SRCAPQ6ZRS2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SRCAPQ6ZRS2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
SRCAPQ6ZRS2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SRCAPQ6ZRS2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SRCAPQ6ZRS2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SRCAPQ6ZRS2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SRCAPQ6ZRS2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SRCAPQ6ZRS2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
SRCAPQ6ZRS2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SRCAPQ6ZRS2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SRCAPQ6ZRS2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms