Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4W1

NSMF, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMFQ6X4W1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NSMFQ6X4W1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NSMFQ6X4W1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NSMFQ6X4W1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NSMFQ6X4W1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NSMFQ6X4W1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NSMFQ6X4W1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NSMFQ6X4W1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NSMFQ6X4W1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NSMFQ6X4W1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NSMFQ6X4W1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NSMFQ6X4W1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NSMFQ6X4W1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NSMFQ6X4W1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NSMFQ6X4W1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NSMFQ6X4W1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NSMFQ6X4W1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NSMFQ6X4W1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NSMFQ6X4W1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NSMFQ6X4W1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NSMFQ6X4W1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NSMFQ6X4W1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NSMFQ6X4W1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NSMFQ6X4W1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NSMFQ6X4W1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NSMFQ6X4W1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NSMFQ6X4W1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NSMFQ6X4W1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NSMFQ6X4W1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NSMFQ6X4W1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NSMFQ6X4W1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NSMFQ6X4W1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NSMFQ6X4W1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NSMFQ6X4W1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NSMFQ6X4W1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NSMFQ6X4W1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NSMFQ6X4W1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NSMFQ6X4W1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSMFQ6X4W1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSMFQ6X4W1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSMFQ6X4W1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSMFQ6X4W1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NSMFQ6X4W1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSMFQ6X4W1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSMFQ6X4W1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NSMFQ6X4W1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSMFQ6X4W1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSMFQ6X4W1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSMFQ6X4W1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSMFQ6X4W1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSMFQ6X4W1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSMFQ6X4W1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NSMFQ6X4W1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NSMFQ6X4W1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NSMFQ6X4W1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NSMFQ6X4W1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NSMFQ6X4W1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NSMFQ6X4W1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NSMFQ6X4W1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NSMFQ6X4W1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NSMFQ6X4W1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NSMFQ6X4W1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NSMFQ6X4W1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NSMFQ6X4W1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NSMFQ6X4W1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NSMFQ6X4W1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NSMFQ6X4W1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NSMFQ6X4W1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NSMFQ6X4W1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NSMFQ6X4W1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NSMFQ6X4W1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
NSMFQ6X4W1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NSMFQ6X4W1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NSMFQ6X4W1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NSMFQ6X4W1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NSMFQ6X4W1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NSMFQ6X4W1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NSMFQ6X4W1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NSMFQ6X4W1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NSMFQ6X4W1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NSMFQ6X4W1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NSMFQ6X4W1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NSMFQ6X4W1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NSMFQ6X4W1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NSMFQ6X4W1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NSMFQ6X4W1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NSMFQ6X4W1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NSMFQ6X4W1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NSMFQ6X4W1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NSMFQ6X4W1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NSMFQ6X4W1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NSMFQ6X4W1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NSMFQ6X4W1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NSMFQ6X4W1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NSMFQ6X4W1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NSMFQ6X4W1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NSMFQ6X4W1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NSMFQ6X4W1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NSMFQ6X4W1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NSMFQ6X4W1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms