Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXT8

ALKAL1, ALK and LTK ligand 1, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKAL1Q6UXT8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALKAL1Q6UXT8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ALKAL1Q6UXT8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALKAL1Q6UXT8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALKAL1Q6UXT8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALKAL1Q6UXT8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALKAL1Q6UXT8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALKAL1Q6UXT8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALKAL1Q6UXT8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALKAL1Q6UXT8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALKAL1Q6UXT8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALKAL1Q6UXT8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALKAL1Q6UXT8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALKAL1Q6UXT8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALKAL1Q6UXT8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALKAL1Q6UXT8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALKAL1Q6UXT8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALKAL1Q6UXT8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALKAL1Q6UXT8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALKAL1Q6UXT8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALKAL1Q6UXT8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALKAL1Q6UXT8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALKAL1Q6UXT8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALKAL1Q6UXT8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALKAL1Q6UXT8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALKAL1Q6UXT8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALKAL1Q6UXT8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALKAL1Q6UXT8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALKAL1Q6UXT8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALKAL1Q6UXT8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ALKAL1Q6UXT8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALKAL1Q6UXT8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALKAL1Q6UXT8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALKAL1Q6UXT8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALKAL1Q6UXT8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALKAL1Q6UXT8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALKAL1Q6UXT8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALKAL1Q6UXT8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALKAL1Q6UXT8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALKAL1Q6UXT8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALKAL1Q6UXT8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALKAL1Q6UXT8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALKAL1Q6UXT8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALKAL1Q6UXT8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALKAL1Q6UXT8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALKAL1Q6UXT8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALKAL1Q6UXT8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALKAL1Q6UXT8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ALKAL1Q6UXT8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ALKAL1Q6UXT8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALKAL1Q6UXT8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALKAL1Q6UXT8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALKAL1Q6UXT8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALKAL1Q6UXT8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALKAL1Q6UXT8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALKAL1Q6UXT8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ALKAL1Q6UXT8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALKAL1Q6UXT8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALKAL1Q6UXT8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALKAL1Q6UXT8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALKAL1Q6UXT8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALKAL1Q6UXT8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ALKAL1Q6UXT8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALKAL1Q6UXT8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALKAL1Q6UXT8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALKAL1Q6UXT8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALKAL1Q6UXT8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALKAL1Q6UXT8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALKAL1Q6UXT8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALKAL1Q6UXT8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ALKAL1Q6UXT8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALKAL1Q6UXT8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALKAL1Q6UXT8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALKAL1Q6UXT8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALKAL1Q6UXT8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ALKAL1Q6UXT8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ALKAL1Q6UXT8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
ALKAL1Q6UXT8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALKAL1Q6UXT8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALKAL1Q6UXT8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALKAL1Q6UXT8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALKAL1Q6UXT8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALKAL1Q6UXT8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALKAL1Q6UXT8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALKAL1Q6UXT8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALKAL1Q6UXT8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALKAL1Q6UXT8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALKAL1Q6UXT8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALKAL1Q6UXT8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALKAL1Q6UXT8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALKAL1Q6UXT8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALKAL1Q6UXT8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALKAL1Q6UXT8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALKAL1Q6UXT8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALKAL1Q6UXT8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALKAL1Q6UXT8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALKAL1Q6UXT8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALKAL1Q6UXT8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALKAL1Q6UXT8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALKAL1Q6UXT8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 284.1 ms