Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF3

SCIMP, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCIMPQ6UWF3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCIMPQ6UWF3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCIMPQ6UWF3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCIMPQ6UWF3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCIMPQ6UWF3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCIMPQ6UWF3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCIMPQ6UWF3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCIMPQ6UWF3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCIMPQ6UWF3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCIMPQ6UWF3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCIMPQ6UWF3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCIMPQ6UWF3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCIMPQ6UWF3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCIMPQ6UWF3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCIMPQ6UWF3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCIMPQ6UWF3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCIMPQ6UWF3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCIMPQ6UWF3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SCIMPQ6UWF3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCIMPQ6UWF3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCIMPQ6UWF3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCIMPQ6UWF3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCIMPQ6UWF3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SCIMPQ6UWF3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCIMPQ6UWF3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCIMPQ6UWF3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCIMPQ6UWF3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCIMPQ6UWF3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCIMPQ6UWF3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCIMPQ6UWF3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCIMPQ6UWF3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCIMPQ6UWF3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCIMPQ6UWF3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCIMPQ6UWF3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCIMPQ6UWF3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCIMPQ6UWF3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCIMPQ6UWF3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCIMPQ6UWF3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SCIMPQ6UWF3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SCIMPQ6UWF3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCIMPQ6UWF3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCIMPQ6UWF3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCIMPQ6UWF3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCIMPQ6UWF3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCIMPQ6UWF3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCIMPQ6UWF3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCIMPQ6UWF3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCIMPQ6UWF3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SCIMPQ6UWF3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCIMPQ6UWF3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCIMPQ6UWF3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCIMPQ6UWF3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCIMPQ6UWF3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCIMPQ6UWF3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCIMPQ6UWF3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCIMPQ6UWF3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCIMPQ6UWF3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCIMPQ6UWF3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCIMPQ6UWF3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCIMPQ6UWF3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCIMPQ6UWF3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCIMPQ6UWF3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCIMPQ6UWF3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCIMPQ6UWF3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCIMPQ6UWF3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCIMPQ6UWF3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCIMPQ6UWF3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCIMPQ6UWF3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCIMPQ6UWF3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCIMPQ6UWF3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCIMPQ6UWF3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCIMPQ6UWF3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms