Protein–RNA interactions for Protein: Q6SZW1

SARM1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARM1Q6SZW1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SARM1Q6SZW1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SARM1Q6SZW1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SARM1Q6SZW1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SARM1Q6SZW1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SARM1Q6SZW1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SARM1Q6SZW1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SARM1Q6SZW1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SARM1Q6SZW1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SARM1Q6SZW1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SARM1Q6SZW1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SARM1Q6SZW1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SARM1Q6SZW1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SARM1Q6SZW1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SARM1Q6SZW1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SARM1Q6SZW1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SARM1Q6SZW1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SARM1Q6SZW1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SARM1Q6SZW1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SARM1Q6SZW1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SARM1Q6SZW1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SARM1Q6SZW1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SARM1Q6SZW1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SARM1Q6SZW1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SARM1Q6SZW1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SARM1Q6SZW1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SARM1Q6SZW1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SARM1Q6SZW1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SARM1Q6SZW1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SARM1Q6SZW1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SARM1Q6SZW1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SARM1Q6SZW1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SARM1Q6SZW1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SARM1Q6SZW1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SARM1Q6SZW1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SARM1Q6SZW1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SARM1Q6SZW1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SARM1Q6SZW1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SARM1Q6SZW1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SARM1Q6SZW1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SARM1Q6SZW1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SARM1Q6SZW1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SARM1Q6SZW1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SARM1Q6SZW1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SARM1Q6SZW1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SARM1Q6SZW1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SARM1Q6SZW1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SARM1Q6SZW1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SARM1Q6SZW1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SARM1Q6SZW1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms