Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q5P6

TY4A-H, Transposon Ty4-H Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY4A-HQ6Q5P6 AVT4YNL101W 2142 nt7.09□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 EMW1YNL313C 2715 nt7.08□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 SUF3tG(CCC)D 72 nt7.08□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 DOC1YGL240W 753 nt7.08□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 SAY1YGR263C 1275 nt7.08□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 YJR142WYJR142W 1029 nt7.08□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 RPR1RPR1 369 nt7.08□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 ISC1YER019W 1434 nt7.08□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 DLD1YDL174C 1764 nt7.08□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 YPL247CYPL247C 1572 nt7.08□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 YLH47YPR125W 1365 nt7.08□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 SLA2YNL243W 2907 nt7.07□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 YDR220CYDR220C 294 nt7.07□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 TIF2YJL138C 1188 nt7.07□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 TIF1YKR059W 1188 nt7.07□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 JNM1YMR294W 1122 nt7.07□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 RPL5YPL131W 894 nt7.07□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 YPL136WYPL136W 369 nt7.07□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 CHL4YDR254W 1377 nt7.07□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 PRP46YPL151C 1356 nt7.07□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 SPS1YDR523C 1473 nt7.06□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 CEF1YMR213W 1773 nt7.06□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 ERJ5YFR041C 888 nt7.06□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt7.06□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt7.06□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 YUR1YJL139C 1287 nt7.06□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 MFA2YNL145W 117 nt7.06□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 ATP23YNR020C 813 nt7.06□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 IMA2YOL157C 1770 nt7.05□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 PSA1YDL055C 1086 nt7.05□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 YFT2YDR319C 825 nt7.05□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 YGL218WYGL218W 651 nt7.05□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 LST7YGR057C 729 nt7.05□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 GTO1YGR154C 1071 nt7.05□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 YIL086CYIL086C 309 nt7.05□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 MPM1YJL066C 759 nt7.05□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 SPC42YKL042W 1092 nt7.05□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 YLR407WYLR407W 687 nt7.05□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 RUF5-1RUF5-1 710 nt7.05□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 RUF5-2RUF5-2 710 nt7.05□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 MSI1YBR195C 1269 nt7.05□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 YPT10YBR264C 600 nt7.05□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 HRB1YNL004W 1365 nt7.05□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 ENP1YBR247C 1452 nt7.04□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 SKI2YLR398C 3864 nt7.04□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 PRP9YDL030W 1593 nt7.04□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 GRX6YDL010W 696 nt7.04□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 PUP2YGR253C 783 nt7.04□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 MRPL6YHR147C 645 nt7.04□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 CBT1YKL208W 816 nt7.04□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 RPL43AYPR043W 279 nt7.04□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 PPT1YGR123C 1542 nt7.04□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 SRP101YDR292C 1866 nt7.04□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 ARH1YDR376W 1482 nt7.04□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 MSG5YNL053W 1470 nt7.04□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 HFI1YPL254W 1467 nt7.04□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 YMR027WYMR027W 1413 nt7.03□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 IMG2YCR071C 441 nt7.03□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 STS1YIR011C 960 nt7.03□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 YAL064WYAL064W 285 nt7.03□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 YLL017WYLL017W 312 nt7.03□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 TLG2YOL018C 1194 nt7.03□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 YOL099CYOL099C 492 nt7.03□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 YOL162WYOL162W 648 nt7.03□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 ASN1YPR145W 1719 nt7.03□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 IVY1YDR229W 1362 nt7.03□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 UME1YPL139C 1383 nt7.03□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 NFI1YOR156C 2181 nt7.03□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 MIF2YKL089W 1650 nt7.03□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 RRP14YKL082C 1305 nt7.02□□□□□ -1.28
TY4A-HQ6Q5P6 HXT2YMR011W 1626 nt7.02□□□□□ -1.29
TY4A-HQ6Q5P6 PCL2YDL127W 927 nt7.02□□□□□ -1.29
TY4A-HQ6Q5P6 YDR008CYDR008C 351 nt7.02□□□□□ -1.29
TY4A-HQ6Q5P6 THR1YHR025W 1074 nt7.02□□□□□ -1.29
TY4A-HQ6Q5P6 YHR112CYHR112C 1137 nt7.02□□□□□ -1.29
TY4A-HQ6Q5P6 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt7.02□□□□□ -1.29
TY4A-HQ6Q5P6 YJL144WYJL144W 315 nt7.02□□□□□ -1.29
TY4A-HQ6Q5P6 RPO26YPR187W 468 nt7.02□□□□□ -1.29
TY4A-HQ6Q5P6 YDL114WYDL114W 927 nt7.01□□□□□ -1.29
TY4A-HQ6Q5P6 RPN9YDR427W 1182 nt7.01□□□□□ -1.29
TY4A-HQ6Q5P6 YLF2YHL014C 1218 nt7.01□□□□□ -1.29
TY4A-HQ6Q5P6 ERG27YLR100W 1044 nt7.01□□□□□ -1.29
TY4A-HQ6Q5P6 YOR062CYOR062C 807 nt7.01□□□□□ -1.29
TY4A-HQ6Q5P6 RPN8YOR261C 1017 nt7.01□□□□□ -1.29
TY4A-HQ6Q5P6 PBP2YBR233W 1242 nt7.01□□□□□ -1.29
TY4A-HQ6Q5P6 LUC7YDL087C 786 nt7□□□□□ -1.29
TY4A-HQ6Q5P6 YKL091CYKL091C 933 nt7□□□□□ -1.29
TY4A-HQ6Q5P6 TVP38YKR088C 1014 nt7□□□□□ -1.29
TY4A-HQ6Q5P6 YLR162WYLR162W 357 nt7□□□□□ -1.29
TY4A-HQ6Q5P6 MRPL15YLR312W-A 762 nt7□□□□□ -1.29
TY4A-HQ6Q5P6 RFA2YNL312W 822 nt7□□□□□ -1.29
TY4A-HQ6Q5P6 RGD2YFL047W 2145 nt7□□□□□ -1.29
TY4A-HQ6Q5P6 TUF1YOR187W 1314 nt7□□□□□ -1.29
TY4A-HQ6Q5P6 YDR132CYDR132C 1488 nt6.99□□□□□ -1.29
TY4A-HQ6Q5P6 DEF1YKL054C 2217 nt6.99□□□□□ -1.29
TY4A-HQ6Q5P6 YFL019CYFL019C 354 nt6.99□□□□□ -1.29
TY4A-HQ6Q5P6 ERG20YJL167W 1059 nt6.99□□□□□ -1.29
TY4A-HQ6Q5P6 YLR271WYLR271W 825 nt6.99□□□□□ -1.29
TY4A-HQ6Q5P6 PSY3YLR376C 729 nt6.99□□□□□ -1.29
TY4A-HQ6Q5P6 YNL171CYNL171C 369 nt6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.1 ms