Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTR9Q6PD62 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTR9Q6PD62 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTR9Q6PD62 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CTR9Q6PD62 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTR9Q6PD62 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTR9Q6PD62 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTR9Q6PD62 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTR9Q6PD62 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTR9Q6PD62 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTR9Q6PD62 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTR9Q6PD62 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTR9Q6PD62 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTR9Q6PD62 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTR9Q6PD62 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTR9Q6PD62 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTR9Q6PD62 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTR9Q6PD62 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTR9Q6PD62 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTR9Q6PD62 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTR9Q6PD62 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTR9Q6PD62 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTR9Q6PD62 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CTR9Q6PD62 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
CTR9Q6PD62 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CTR9Q6PD62 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CTR9Q6PD62 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CTR9Q6PD62 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CTR9Q6PD62 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTR9Q6PD62 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTR9Q6PD62 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTR9Q6PD62 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTR9Q6PD62 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTR9Q6PD62 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTR9Q6PD62 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTR9Q6PD62 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTR9Q6PD62 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTR9Q6PD62 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTR9Q6PD62 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTR9Q6PD62 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTR9Q6PD62 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTR9Q6PD62 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTR9Q6PD62 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTR9Q6PD62 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTR9Q6PD62 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CTR9Q6PD62 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTR9Q6PD62 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTR9Q6PD62 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CTR9Q6PD62 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTR9Q6PD62 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTR9Q6PD62 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTR9Q6PD62 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTR9Q6PD62 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTR9Q6PD62 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTR9Q6PD62 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTR9Q6PD62 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTR9Q6PD62 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTR9Q6PD62 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CTR9Q6PD62 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTR9Q6PD62 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTR9Q6PD62 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CTR9Q6PD62 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTR9Q6PD62 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTR9Q6PD62 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTR9Q6PD62 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTR9Q6PD62 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CTR9Q6PD62 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CTR9Q6PD62 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CTR9Q6PD62 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CTR9Q6PD62 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTR9Q6PD62 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTR9Q6PD62 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTR9Q6PD62 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTR9Q6PD62 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CTR9Q6PD62 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTR9Q6PD62 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTR9Q6PD62 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTR9Q6PD62 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTR9Q6PD62 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTR9Q6PD62 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTR9Q6PD62 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTR9Q6PD62 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTR9Q6PD62 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTR9Q6PD62 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CTR9Q6PD62 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTR9Q6PD62 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTR9Q6PD62 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTR9Q6PD62 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTR9Q6PD62 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTR9Q6PD62 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTR9Q6PD62 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTR9Q6PD62 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTR9Q6PD62 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTR9Q6PD62 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTR9Q6PD62 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTR9Q6PD62 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTR9Q6PD62 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTR9Q6PD62 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTR9Q6PD62 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTR9Q6PD62 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms