Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNNM4Q6P4Q7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNNM4Q6P4Q7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNNM4Q6P4Q7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CNNM4Q6P4Q7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNNM4Q6P4Q7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNNM4Q6P4Q7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNNM4Q6P4Q7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CNNM4Q6P4Q7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CNNM4Q6P4Q7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNNM4Q6P4Q7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNNM4Q6P4Q7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CNNM4Q6P4Q7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNNM4Q6P4Q7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNNM4Q6P4Q7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNNM4Q6P4Q7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNNM4Q6P4Q7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNNM4Q6P4Q7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CNNM4Q6P4Q7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNNM4Q6P4Q7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNNM4Q6P4Q7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNNM4Q6P4Q7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNNM4Q6P4Q7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNNM4Q6P4Q7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNNM4Q6P4Q7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNNM4Q6P4Q7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNNM4Q6P4Q7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CNNM4Q6P4Q7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNNM4Q6P4Q7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNNM4Q6P4Q7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNNM4Q6P4Q7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNNM4Q6P4Q7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CNNM4Q6P4Q7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNNM4Q6P4Q7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNNM4Q6P4Q7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNNM4Q6P4Q7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNNM4Q6P4Q7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CNNM4Q6P4Q7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNNM4Q6P4Q7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNNM4Q6P4Q7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNNM4Q6P4Q7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNNM4Q6P4Q7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNNM4Q6P4Q7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNNM4Q6P4Q7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CNNM4Q6P4Q7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNNM4Q6P4Q7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNNM4Q6P4Q7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNNM4Q6P4Q7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNNM4Q6P4Q7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNNM4Q6P4Q7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CNNM4Q6P4Q7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNNM4Q6P4Q7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNNM4Q6P4Q7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNNM4Q6P4Q7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNNM4Q6P4Q7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNNM4Q6P4Q7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CNNM4Q6P4Q7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNNM4Q6P4Q7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNNM4Q6P4Q7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CNNM4Q6P4Q7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CNNM4Q6P4Q7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CNNM4Q6P4Q7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CNNM4Q6P4Q7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CNNM4Q6P4Q7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNNM4Q6P4Q7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNNM4Q6P4Q7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CNNM4Q6P4Q7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNNM4Q6P4Q7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CNNM4Q6P4Q7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNNM4Q6P4Q7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNNM4Q6P4Q7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CNNM4Q6P4Q7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNNM4Q6P4Q7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNNM4Q6P4Q7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CNNM4Q6P4Q7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNNM4Q6P4Q7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CNNM4Q6P4Q7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNNM4Q6P4Q7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNNM4Q6P4Q7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNNM4Q6P4Q7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNNM4Q6P4Q7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CNNM4Q6P4Q7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNNM4Q6P4Q7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNNM4Q6P4Q7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNNM4Q6P4Q7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNNM4Q6P4Q7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNNM4Q6P4Q7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNNM4Q6P4Q7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNNM4Q6P4Q7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNNM4Q6P4Q7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNNM4Q6P4Q7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNNM4Q6P4Q7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNNM4Q6P4Q7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNNM4Q6P4Q7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNNM4Q6P4Q7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNNM4Q6P4Q7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNNM4Q6P4Q7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CNNM4Q6P4Q7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNNM4Q6P4Q7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNNM4Q6P4Q7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms