Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASC4Q6P4E1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASC4Q6P4E1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASC4Q6P4E1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASC4Q6P4E1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASC4Q6P4E1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASC4Q6P4E1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASC4Q6P4E1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASC4Q6P4E1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASC4Q6P4E1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASC4Q6P4E1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASC4Q6P4E1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASC4Q6P4E1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CASC4Q6P4E1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CASC4Q6P4E1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASC4Q6P4E1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CASC4Q6P4E1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CASC4Q6P4E1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CASC4Q6P4E1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASC4Q6P4E1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASC4Q6P4E1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CASC4Q6P4E1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASC4Q6P4E1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASC4Q6P4E1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASC4Q6P4E1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASC4Q6P4E1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASC4Q6P4E1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASC4Q6P4E1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASC4Q6P4E1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CASC4Q6P4E1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASC4Q6P4E1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASC4Q6P4E1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASC4Q6P4E1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CASC4Q6P4E1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASC4Q6P4E1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASC4Q6P4E1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASC4Q6P4E1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CASC4Q6P4E1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASC4Q6P4E1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASC4Q6P4E1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASC4Q6P4E1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASC4Q6P4E1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASC4Q6P4E1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASC4Q6P4E1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASC4Q6P4E1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASC4Q6P4E1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CASC4Q6P4E1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASC4Q6P4E1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASC4Q6P4E1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASC4Q6P4E1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASC4Q6P4E1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASC4Q6P4E1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASC4Q6P4E1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASC4Q6P4E1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASC4Q6P4E1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASC4Q6P4E1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASC4Q6P4E1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASC4Q6P4E1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASC4Q6P4E1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASC4Q6P4E1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASC4Q6P4E1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASC4Q6P4E1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASC4Q6P4E1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASC4Q6P4E1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASC4Q6P4E1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASC4Q6P4E1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASC4Q6P4E1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASC4Q6P4E1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASC4Q6P4E1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASC4Q6P4E1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASC4Q6P4E1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASC4Q6P4E1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASC4Q6P4E1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASC4Q6P4E1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASC4Q6P4E1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASC4Q6P4E1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASC4Q6P4E1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASC4Q6P4E1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASC4Q6P4E1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASC4Q6P4E1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASC4Q6P4E1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASC4Q6P4E1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASC4Q6P4E1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASC4Q6P4E1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASC4Q6P4E1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASC4Q6P4E1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASC4Q6P4E1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASC4Q6P4E1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CASC4Q6P4E1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASC4Q6P4E1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASC4Q6P4E1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASC4Q6P4E1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASC4Q6P4E1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASC4Q6P4E1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASC4Q6P4E1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASC4Q6P4E1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASC4Q6P4E1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASC4Q6P4E1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASC4Q6P4E1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASC4Q6P4E1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms