Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
EDC4Q6P2E9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.83
EDC4Q6P2E9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
EDC4Q6P2E9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
EDC4Q6P2E9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
EDC4Q6P2E9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
EDC4Q6P2E9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
EDC4Q6P2E9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
EDC4Q6P2E9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
EDC4Q6P2E9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
EDC4Q6P2E9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
EDC4Q6P2E9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
EDC4Q6P2E9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
EDC4Q6P2E9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
EDC4Q6P2E9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
EDC4Q6P2E9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
EDC4Q6P2E9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
EDC4Q6P2E9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
EDC4Q6P2E9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
EDC4Q6P2E9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
EDC4Q6P2E9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
EDC4Q6P2E9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
EDC4Q6P2E9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
EDC4Q6P2E9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
EDC4Q6P2E9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
EDC4Q6P2E9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
EDC4Q6P2E9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
EDC4Q6P2E9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
EDC4Q6P2E9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
EDC4Q6P2E9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
EDC4Q6P2E9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
EDC4Q6P2E9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
EDC4Q6P2E9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
EDC4Q6P2E9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
EDC4Q6P2E9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
EDC4Q6P2E9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
EDC4Q6P2E9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
EDC4Q6P2E9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
EDC4Q6P2E9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
EDC4Q6P2E9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
EDC4Q6P2E9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
EDC4Q6P2E9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
EDC4Q6P2E9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
EDC4Q6P2E9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
EDC4Q6P2E9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
EDC4Q6P2E9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
EDC4Q6P2E9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
EDC4Q6P2E9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
EDC4Q6P2E9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
EDC4Q6P2E9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
EDC4Q6P2E9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
EDC4Q6P2E9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
EDC4Q6P2E9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
EDC4Q6P2E9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
EDC4Q6P2E9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
EDC4Q6P2E9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
EDC4Q6P2E9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
EDC4Q6P2E9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
EDC4Q6P2E9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
EDC4Q6P2E9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
EDC4Q6P2E9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
EDC4Q6P2E9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
EDC4Q6P2E9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
EDC4Q6P2E9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC32.64■■■□□ 2.81
EDC4Q6P2E9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
EDC4Q6P2E9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
EDC4Q6P2E9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
EDC4Q6P2E9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
EDC4Q6P2E9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
EDC4Q6P2E9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
EDC4Q6P2E9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
EDC4Q6P2E9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
EDC4Q6P2E9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
EDC4Q6P2E9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
EDC4Q6P2E9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
EDC4Q6P2E9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
EDC4Q6P2E9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
EDC4Q6P2E9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
EDC4Q6P2E9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
EDC4Q6P2E9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
EDC4Q6P2E9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
EDC4Q6P2E9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
EDC4Q6P2E9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
EDC4Q6P2E9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
EDC4Q6P2E9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
EDC4Q6P2E9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
EDC4Q6P2E9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
EDC4Q6P2E9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
EDC4Q6P2E9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
EDC4Q6P2E9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
EDC4Q6P2E9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
EDC4Q6P2E9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
EDC4Q6P2E9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
EDC4Q6P2E9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
EDC4Q6P2E9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
EDC4Q6P2E9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.81
EDC4Q6P2E9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
EDC4Q6P2E9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
EDC4Q6P2E9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
EDC4Q6P2E9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.4 ms