Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
REEP3Q6NUK4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
REEP3Q6NUK4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
REEP3Q6NUK4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REEP3Q6NUK4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
REEP3Q6NUK4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REEP3Q6NUK4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REEP3Q6NUK4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
REEP3Q6NUK4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
REEP3Q6NUK4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
REEP3Q6NUK4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
REEP3Q6NUK4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REEP3Q6NUK4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
REEP3Q6NUK4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
REEP3Q6NUK4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
REEP3Q6NUK4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
REEP3Q6NUK4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
REEP3Q6NUK4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
REEP3Q6NUK4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
REEP3Q6NUK4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
REEP3Q6NUK4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
REEP3Q6NUK4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
REEP3Q6NUK4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
REEP3Q6NUK4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
REEP3Q6NUK4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
REEP3Q6NUK4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
REEP3Q6NUK4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
REEP3Q6NUK4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
REEP3Q6NUK4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
REEP3Q6NUK4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
REEP3Q6NUK4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
REEP3Q6NUK4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
REEP3Q6NUK4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
REEP3Q6NUK4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
REEP3Q6NUK4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
REEP3Q6NUK4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
REEP3Q6NUK4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
REEP3Q6NUK4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
REEP3Q6NUK4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
REEP3Q6NUK4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
REEP3Q6NUK4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
REEP3Q6NUK4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REEP3Q6NUK4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REEP3Q6NUK4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
REEP3Q6NUK4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
REEP3Q6NUK4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REEP3Q6NUK4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REEP3Q6NUK4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
REEP3Q6NUK4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
REEP3Q6NUK4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REEP3Q6NUK4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REEP3Q6NUK4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
REEP3Q6NUK4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REEP3Q6NUK4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REEP3Q6NUK4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
REEP3Q6NUK4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
REEP3Q6NUK4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REEP3Q6NUK4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
REEP3Q6NUK4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
REEP3Q6NUK4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
REEP3Q6NUK4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REEP3Q6NUK4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REEP3Q6NUK4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
REEP3Q6NUK4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
REEP3Q6NUK4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
REEP3Q6NUK4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
REEP3Q6NUK4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
REEP3Q6NUK4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REEP3Q6NUK4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REEP3Q6NUK4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
REEP3Q6NUK4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
REEP3Q6NUK4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
REEP3Q6NUK4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REEP3Q6NUK4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
REEP3Q6NUK4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REEP3Q6NUK4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REEP3Q6NUK4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
REEP3Q6NUK4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REEP3Q6NUK4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
REEP3Q6NUK4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REEP3Q6NUK4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REEP3Q6NUK4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
REEP3Q6NUK4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
REEP3Q6NUK4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
REEP3Q6NUK4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REEP3Q6NUK4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REEP3Q6NUK4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
REEP3Q6NUK4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REEP3Q6NUK4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
REEP3Q6NUK4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REEP3Q6NUK4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REEP3Q6NUK4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
REEP3Q6NUK4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
REEP3Q6NUK4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
REEP3Q6NUK4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
REEP3Q6NUK4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
REEP3Q6NUK4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
REEP3Q6NUK4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
REEP3Q6NUK4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
REEP3Q6NUK4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms