Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8Q7

PDE12, 2',5'-phosphodiesterase 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE12Q6L8Q7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE12Q6L8Q7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE12Q6L8Q7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE12Q6L8Q7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE12Q6L8Q7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE12Q6L8Q7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDE12Q6L8Q7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE12Q6L8Q7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDE12Q6L8Q7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE12Q6L8Q7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE12Q6L8Q7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE12Q6L8Q7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE12Q6L8Q7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE12Q6L8Q7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE12Q6L8Q7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDE12Q6L8Q7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE12Q6L8Q7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE12Q6L8Q7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE12Q6L8Q7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE12Q6L8Q7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE12Q6L8Q7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDE12Q6L8Q7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PDE12Q6L8Q7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE12Q6L8Q7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE12Q6L8Q7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE12Q6L8Q7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE12Q6L8Q7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE12Q6L8Q7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDE12Q6L8Q7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE12Q6L8Q7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE12Q6L8Q7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE12Q6L8Q7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE12Q6L8Q7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE12Q6L8Q7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE12Q6L8Q7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE12Q6L8Q7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE12Q6L8Q7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE12Q6L8Q7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE12Q6L8Q7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE12Q6L8Q7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE12Q6L8Q7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE12Q6L8Q7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE12Q6L8Q7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE12Q6L8Q7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE12Q6L8Q7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE12Q6L8Q7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE12Q6L8Q7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE12Q6L8Q7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE12Q6L8Q7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE12Q6L8Q7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE12Q6L8Q7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE12Q6L8Q7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE12Q6L8Q7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE12Q6L8Q7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE12Q6L8Q7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE12Q6L8Q7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE12Q6L8Q7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE12Q6L8Q7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE12Q6L8Q7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE12Q6L8Q7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE12Q6L8Q7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE12Q6L8Q7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE12Q6L8Q7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE12Q6L8Q7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE12Q6L8Q7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE12Q6L8Q7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE12Q6L8Q7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE12Q6L8Q7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PDE12Q6L8Q7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDE12Q6L8Q7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE12Q6L8Q7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE12Q6L8Q7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE12Q6L8Q7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE12Q6L8Q7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE12Q6L8Q7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE12Q6L8Q7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE12Q6L8Q7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE12Q6L8Q7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE12Q6L8Q7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE12Q6L8Q7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE12Q6L8Q7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE12Q6L8Q7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE12Q6L8Q7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDE12Q6L8Q7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE12Q6L8Q7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE12Q6L8Q7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE12Q6L8Q7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE12Q6L8Q7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDE12Q6L8Q7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE12Q6L8Q7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE12Q6L8Q7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE12Q6L8Q7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE12Q6L8Q7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE12Q6L8Q7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE12Q6L8Q7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE12Q6L8Q7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE12Q6L8Q7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE12Q6L8Q7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE12Q6L8Q7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE12Q6L8Q7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms