Protein–RNA interactions for Protein: Q6IAA8

LAMTOR1, Ragulator complex protein LAMTOR1, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR1Q6IAA8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LAMTOR1Q6IAA8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMTOR1Q6IAA8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMTOR1Q6IAA8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMTOR1Q6IAA8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMTOR1Q6IAA8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMTOR1Q6IAA8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMTOR1Q6IAA8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMTOR1Q6IAA8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMTOR1Q6IAA8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMTOR1Q6IAA8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMTOR1Q6IAA8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMTOR1Q6IAA8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMTOR1Q6IAA8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LAMTOR1Q6IAA8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMTOR1Q6IAA8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMTOR1Q6IAA8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMTOR1Q6IAA8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMTOR1Q6IAA8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMTOR1Q6IAA8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMTOR1Q6IAA8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMTOR1Q6IAA8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMTOR1Q6IAA8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMTOR1Q6IAA8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMTOR1Q6IAA8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMTOR1Q6IAA8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMTOR1Q6IAA8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMTOR1Q6IAA8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMTOR1Q6IAA8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMTOR1Q6IAA8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMTOR1Q6IAA8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMTOR1Q6IAA8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMTOR1Q6IAA8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMTOR1Q6IAA8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMTOR1Q6IAA8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMTOR1Q6IAA8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMTOR1Q6IAA8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMTOR1Q6IAA8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMTOR1Q6IAA8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMTOR1Q6IAA8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LAMTOR1Q6IAA8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LAMTOR1Q6IAA8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMTOR1Q6IAA8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMTOR1Q6IAA8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAMTOR1Q6IAA8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LAMTOR1Q6IAA8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LAMTOR1Q6IAA8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LAMTOR1Q6IAA8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LAMTOR1Q6IAA8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms