Protein–RNA interactions for Protein: Q68G75

LEMD1, LEM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD1Q68G75 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LEMD1Q68G75 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LEMD1Q68G75 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LEMD1Q68G75 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms