Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RSBN1Q5VWQ0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RSBN1Q5VWQ0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RSBN1Q5VWQ0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RSBN1Q5VWQ0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RSBN1Q5VWQ0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RSBN1Q5VWQ0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
RSBN1Q5VWQ0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RSBN1Q5VWQ0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RSBN1Q5VWQ0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RSBN1Q5VWQ0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RSBN1Q5VWQ0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RSBN1Q5VWQ0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSBN1Q5VWQ0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RSBN1Q5VWQ0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSBN1Q5VWQ0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSBN1Q5VWQ0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSBN1Q5VWQ0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSBN1Q5VWQ0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSBN1Q5VWQ0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSBN1Q5VWQ0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSBN1Q5VWQ0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSBN1Q5VWQ0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSBN1Q5VWQ0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RSBN1Q5VWQ0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSBN1Q5VWQ0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSBN1Q5VWQ0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSBN1Q5VWQ0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSBN1Q5VWQ0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RSBN1Q5VWQ0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RSBN1Q5VWQ0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RSBN1Q5VWQ0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RSBN1Q5VWQ0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RSBN1Q5VWQ0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RSBN1Q5VWQ0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RSBN1Q5VWQ0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSBN1Q5VWQ0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSBN1Q5VWQ0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSBN1Q5VWQ0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSBN1Q5VWQ0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSBN1Q5VWQ0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms